数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫VC125株系(基因型tyra-3(ok325)X)的行为实验数据,记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为特征。实验由Laura Grundy执行,采用tierpsy软件追踪分析,包含视频转换文件及行为特征数据文件,总计3个文件。
文件详解
- 行为轨迹文件
- 文件名称:tyra-3 (ok325)X on food R_2010_01_28__14_44310.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的wcon格式数据压缩包,记录线虫运动轨迹的时间序列信息
- 行为特征文件
- 文件名称:tyra-3 (ok325)X on food R_2010_01_28__14_44310_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动、体态等特征指标
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:tyra-3 (ok325)X on food R_2010_01_28__14_44310.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,涉及17791个分割骨架数据,采样帧率20帧/秒,实验总时长899.3秒
数据来源
C.elegans behavioural database(线虫行为数据库)
适用场景
- 线虫神经行为学研究:分析tyra-3基因对秀丽隐杆线虫行为模式的调控作用
- 药物筛选模型构建:基于线虫行为特征数据建立药物筛选或毒性测试的行为学模型
- 基因功能验证:验证tyra-3(ok325)突变体的行为表型,研究该基因在神经信号传导中的功能
- 行为分析算法优化:用于评估和优化线虫行为追踪算法的准确性和效率
- 模式生物行为数据库补充:为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的实验数据支撑