数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB1958品系(npr-20基因ok2575突变体)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2011年9月开展,包含线虫在NGM培养基上的运动行为记录及分析结果,涉及基因、品系、实验条件、视频参数等信息,可用于线虫行为学研究。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名称:T07D4.1 (ok2575)II on food L_2011_09_13__16_37412_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,具体字段未明确说明,推测包含运动轨迹、骨架特征等行为分析结果
- 行为数据压缩文件:
- 文件名称:T07D4.1 (ok2575)II on food L_2011_09_13__16_37412.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩格式的线虫行为数据文件,具体内容未明确说明
- 核心实验数据文件:
- 文件名称:T07D4.1 (ok2575)II on food L_2011_09_13__16_37412.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验核心数据,推测包含原始视频解析后的线虫行为记录,如运动时间、骨架分段数等参数对应的结构化数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析npr-20基因ok2575突变对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 分子生物学行为实验验证:验证线虫在特定培养基(NGM agar low peptone)和食物(OP50)条件下的行为模式
- 线虫行为分析方法优化:基于tierpsy软件生成的行为数据,优化线虫行为追踪与特征提取算法
- 实验室间数据对比:作为标准化线虫行为实验数据,用于不同实验室同类研究的结果对比与整合分析