数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫VC1309品系(携带nlp-8基因ok1799突变体)的行为实验数据,属于C.elegans行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包含视频追踪结果、特征提取数据及标准化行为数据文件,可用于线虫基因功能与行为表型关联研究。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:nlp-8 (ok1799)I on food L_2010_03_18__10_5533.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含标准化行为数据(wcon格式),记录线虫运动轨迹、姿态等时序行为信息
- 特征数据文件
- 文件名称:nlp-8 (ok1799)I on food L_2010_03_18__10_5533_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征,包括运动速度、身体弯曲度、头部摆动频率等量化指标
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:nlp-8 (ok1799)I on food L_2010_03_18__10_5533.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含视频追踪原始数据,记录线虫骨架 segmentation 信息(共17848个分割骨架)、时间戳及空间坐标转换参数(视频像素与微米映射关系为4.02599微米/像素)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析nlp-8基因对秀丽隐杆线虫行为表型的调控作用
- 行为表型量化分析: 利用特征数据研究线虫运动模式、觅食行为等表型特征
- 分子生物学实验验证: 验证基因编辑或药物处理对线虫行为的影响
- 模式生物行为数据库构建: 作为标准化线虫行为数据补充到公共数据库,支持跨实验数据比对
- 计算机视觉在生物实验中的应用: 评估tierpsy软件对线虫行为追踪的准确性与有效性