数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了NL1147菌株(携带gpa-10(pk362)V基因突变)的成虫行为实验数据。实验于2010年2月25日开展,使用NGM低蛋白胨培养基和OP50食物源,记录时长约900秒,包含行为特征提取和原始数据文件,支持线虫基因功能与行为关联研究。
文件详解
- 文件1:gpa-10 (pk362)V on food R_2010_02_25__10_4434_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,由tierpsy软件提取,涉及运动轨迹、骨架分段等行为量化指标
- 文件2:gpa-10 (pk362)V on food R_2010_02_25__10_4434.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:实验原始数据文件,存储视频帧对应的线虫行为原始记录
- 文件3:gpa-10 (pk362)V on food R_2010_02_25__10_4434.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫行为数据,遵循线虫行为数据交换标准
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-10基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 模式生物行为学分析: 基于标准化实验数据探究线虫运动、摄食等行为规律
- 生物信息学算法验证: 作为tierpsy等行为分析软件的测试数据集,验证特征提取准确性
- 神经生物学机制研究: 关联基因表达与行为表型,探索线虫神经调控通路
- 实验方法标准化参考: 为秀丽隐杆线虫行为实验提供标准化方案与数据格式范例