数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了AQ495菌株(gpa-14(pk347)I基因突变体)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为实验数据,包含视频跟踪原始数据及特征提取结果,可用于分析该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:gpa-14 (pk347)I on food R_2010_03_04__11_05_05__7.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含秀丽隐杆线虫行为实验的原始视频跟踪数据,具体字段需解压后查看wcon格式内容
- 特征提取文件
- 文件名称:gpa-14 (pk347)I on food R_2010_03_04__11_05_05__7_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:通过tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、身体姿态等行为特征
- 实验主数据文件
- 文件名称:gpa-14 (pk347)I on food R_2010_03_04__11_05_05__7.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验基础信息(如帧率25.5754帧/秒、像素分辨率4.3011微米/像素)、19998个分割骨架数据及总时长899.495秒的行为记录
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 基因功能研究:分析gpa-14基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经生物学实验:研究线虫神经系统相关基因与行为表型的关联
- 模式生物行为学分析:基于视频跟踪数据开展秀丽隐杆线虫行为模式量化研究
- 实验方法验证:参考实验方案(E. Yemini et al.方法)优化秀丽隐杆线虫行为实验设计