数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了NL787品系gpa-11(pk349)II基因线虫的行为实验数据。实验由剑桥MRC分子生物学实验室完成,包含线虫在NGM培养基上的行为观测记录,涉及视频数据、特征数据及标准化格式数据,共3个文件。
文件详解
- 文件名称:
gpa-11 (pk349)II on food L_2010_03_04__13_02_59___4___13.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为实验原始数据文件,包含实验过程中的基础观测数据
- 文件名称:
gpa-11 (pk349)II on food L_2010_03_04__13_02_59___4___13.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩的标准化线虫行为数据文件,采用wcon格式存储
- 文件名称:
gpa-11 (pk349)II on food L_2010_03_04__13_02_59___4___13_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为特征数据文件,包含20857个分段骨架等特征信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-11基因对秀丽隐杆线虫行为的调控作用
- 行为学实验方法验证: 基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为观测的标准化流程
- 生物图像分析技术应用: 利用tierpsy软件提取的线虫骨架特征,研究图像分析技术在行为学中的应用
- 模式生物行为数据库构建: 作为线虫行为数据库的组成部分,支持大规模行为数据的整合与分析