数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)JT609 eat-16(sa609)I菌株的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基、OP50食物条件下的行为特征,包含视频及分析后的数据文件,可用于研究该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:eat-16 (sa6091) on food L_2010_07_29__16_17_22112.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为记录的原始或标准化数据,具体字段需解压后查看wcon格式内容
- 特征数据文件
- 文件名称:eat-16 (sa6091) on food L_2010_07_29__16_17_22112_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,由tierpsy软件提取,包含26318个分割骨架等特征
- 主数据文件
- 文件名称:eat-16 (sa6091) on food L_2010_07_29__16_17_22112.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验核心数据,对应实验总时长899秒、帧率30.03帧/秒、像素分辨率4.36527微米/像素等参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变体行为表型研究: 分析eat-16(sa609)I突变对C.elegans行为的影响
- 分子生物学实验验证: 验证该基因突变体在特定食物条件下的行为特征
- 行为数据分析方法开发: 基于标准化的线虫行为数据优化特征提取算法
- 线虫行为数据库补充: 作为公开线虫行为数据库的组成部分,支持跨实验对比研究