数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT180 sup-9(n180)II菌株成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为实验数据。实验于2010年7月23日开展,使用tierpsy软件追踪,包含视频及行为特征数据,可用于线虫行为模式研究。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:
sup-9 (n180)II on food L_2010_07_23__12_15___3___7.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含17793个分段骨架信息,对应实验总时长约900秒、每秒20帧的视频采集数据。
- 特征数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:
sup-9 (n180)II on food L_2010_07_23__12_15___3___7_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取数据,基于视频像素与微米的映射关系(4.53292微米/像素)生成行为量化指标。
- 行为数据压缩文件(.zip格式)
- 文件名称:
sup-9 (n180)II on food L_2010_07_23__12_15___3___7.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储线虫行为数据的标准格式文件,用于行为数据的归档与交换。
数据来源
C. elegans behavioural database
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析sup-9基因对秀丽隐杆线虫运动行为模式的影响。
- 神经生物学实验:探究线虫在食物环境中的行为响应机制。
- 模式生物行为学分析:基于追踪数据量化线虫的运动轨迹、速度等行为特征。
- 生物信息学工具验证:测试tierpsy等行为追踪软件在模式生物研究中的应用效果。