数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了npr-3(tm1583)IV基因突变体成虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基上的行为实验数据。实验由MRC分子生物学实验室完成,包含视频追踪原始数据、特征提取结果及标准化行为数据,可用于分析该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为追踪原始数据文件
- 文件名称:npr-3 (tm1583)IV on food L_2010_01_22__11_15_51__4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储秀丽隐杆线虫行为视频的原始追踪数据,包含898.563秒实验时长、每秒27.248帧的图像数据及4.48488微米/像素的尺度信息
- 行为特征提取文件
- 文件名称:npr-3 (tm1583)IV on food L_2010_01_22__11_15_51__4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含22543个分段骨架数据,记录线虫运动过程中的形态特征与行为参数
- 标准化行为数据压缩包
- 文件名称:npr-3 (tm1583)IV on food L_2010_01_22__11_15_51__4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:采用wcon标准格式存储的线虫行为数据,便于跨平台的行为分析与数据共享
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析npr-3基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响机制
- 神经生物学实验验证:验证神经肽受体基因与线虫摄食、运动等行为的关联
- 行为学数据分析方法开发:基于标准化wcon格式数据优化线虫行为特征提取算法
- 生物医学基础研究:为神经退行性疾病、代谢疾病等相关研究提供模式生物行为数据参考