数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB2594 ins-22(ok3616)III品系的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂平板上的行为表现,包含视频追踪数据及特征提取结果,可用于研究ins-22基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:ins-22 (ok3616) on food L_2011_06_07__11_59_3015.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为视频的原始追踪数据,包含26722个分割骨架信息,对应约九百秒、每秒三十点零三帧的视频记录
- 特征数据文件
- 文件名称:ins-22 (ok3616) on food L_2011_06_07__11_59_3015_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、速度等行为学特征指标
- 压缩数据文件
- 文件名称:ins-22 (ok3616) on food L_2011_06_07__11_59_3015.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,可能包含标准化的行为数据记录格式
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究: 分析ins-22基因缺失(ok3616突变)对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 线虫行为学分析: 基于视频追踪数据研究线虫的运动轨迹、速度等行为特征
- 神经生物学研究: 探究ins-22基因相关的神经调控机制与行为表现的关联
- 生物信息学分析: 利用标准化行为数据开发线虫行为特征的分析算法或模型
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的可重复性