数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB559品系srp-8(ok291)V基因突变体线虫的行为实验数据。实验于2011年9月开展,通过视频追踪获取线虫在NGM培养基上的运动行为特征,包含原始追踪数据及特征提取结果,可用于线虫基因功能与行为关联研究。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:srp-8 (ok291)V on food L_2011_09_06__12_52_2384.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包形式存储的行为数据文件,包含线虫运动轨迹的结构化记录
- 追踪数据文件
- 文件名称:srp-8 (ok291)V on food L_2011_09_06__12_52_2384.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的原始数据,包含26958个分割骨架数据,记录30.03帧/秒的运动轨迹信息
- 特征提取文件
- 文件名称:srp-8 (ok291)V on food L_2011_09_06__12_52_2384_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:通过tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动速度、身体弯曲度等行为学指标
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析srp-8基因突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 行为学特征提取:基于视频追踪数据研究线虫运动轨迹、速度等行为参数
- 模式生物实验标准化:参考实验方案(Yemini et al.方法)优化线虫行为学实验设计
- 生物信息学工具验证:测试tierpsy等线虫行为追踪软件的数据分析效果
- 神经生物学机制研究:探索基因调控与线虫运动行为的神经机制关联