数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了DA1814品系(ser-1(ok345)X基因突变体)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为实验数据,包含视频追踪及特征提取结果,可用于研究ser-1基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:ser-1 (ok345) on food L_2009_12_14__10_42_3982.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为的原始或结构化数据(基于wcon格式标准,通常记录线虫运动轨迹、姿态等时序信息)
- 行为追踪数据文件
- 文件名称:ser-1 (ok345) on food L_2009_12_14__10_42_3982.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的原始数据,包括20053个分割骨架信息、视频像素与微米的映射关系(4.55526微米/像素)等
- 行为特征数据文件
- 文件名称:ser-1 (ok345) on food L_2009_12_14__10_42_3982_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的线虫行为特征数据,实验总时长899.938秒,帧率25.974帧/秒
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析ser-1基因(ok345等位基因)对秀丽隐杆线虫行为表型的调控作用
- 行为学实验方法验证:基于E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为追踪与特征提取的标准化流程
- 模式生物行为分析:研究成年雌雄同体线虫在特定培养基(NGM低蛋白胨琼脂)及食物(OP50)条件下的行为模式
- 生物图像特征提取应用:利用tierpsy软件提取的线虫骨架及行为特征,开发或优化模式生物行为分析算法