数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了CB270菌株(unc-42(e270)V基因突变体)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为实验数据,包含视频追踪原始数据、特征提取数据及标准化格式数据,用于研究该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:unc-42 (e270)I on food R_2010_08_20__11_5736.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为视频的原始追踪数据,包含21584个分段骨架信息,视频帧率24.0385帧/秒,像素分辨率4.53292微米/像素
- 特征提取数据文件
- 文件名称:unc-42 (e270)I on food R_2010_08_20__11_5736_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:通过tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、身体姿态等量化指标
- 标准化格式压缩文件
- 文件名称:unc-42 (e270)I on food R_2010_08_20__11_5736.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:采用wcon标准格式存储的线虫行为数据压缩包,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经生物学研究:分析unc-42基因突变体的行为模式,探究该基因在神经发育与功能中的作用
- 基因功能验证:通过行为学数据验证unc-42基因对秀丽隐杆线虫运动、觅食等行为的调控机制
- 模式生物行为分析:作为标准化线虫行为实验数据,支持线虫行为学研究方法的优化与比较
- 生物信息学算法测试:用于验证线虫行为追踪与特征提取算法的准确性与效率