数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了VC282 pdl-1(gk157)II品系成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基上的行为实验数据。实验于2011年8月4日进行,包含视频记录及经tierpsy软件处理后的行为特征数据,可用于分析线虫的运动行为模式。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:pdl-1 (gk157)II on food L_2011_08_04__13_19_4879_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,基于26429个分割骨架计算得到
- 原始处理数据文件
- 文件名称:pdl-1 (gk157)II on food L_2011_08_04__13_19_4879.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验的核心行为数据,对应实验总时长899秒、帧率30.03帧/秒、像素分辨率4.11384微米/像素
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:pdl-1 (gk157)II on food L_2011_08_04__13_19_4879.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的线虫行为数据压缩包,用于数据存储与传输
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为遗传学研究:分析pdl-1基因对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 模式生物行为分析:基于视频及特征数据研究线虫在食物环境中的运动模式
- 生物行为软件验证:测试tierpsy等线虫行为追踪软件的特征提取效果
- 实验方法复现:参考实验方案(如30分钟适应期、视频录制参数)开展同类线虫行为实验