数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了2010年4月22日开展的RB1374品系(ocr-3(ok1559)X等位基因)秀丽隐杆线虫成虫的行为实验数据。实验由剑桥MRC分子生物学实验室完成,通过tierpsy软件追踪线虫在NGM培养基上的运动行为,包含特征数据、wcon格式数据及原始追踪数据等3个文件。
文件详解
- 文件名称:ocr-3 (ok1557) on food L_2010_04_22__11_30_1287_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动特征(如骨架坐标、速度等)
- 文件名称:ocr-3 (ok1557) on food L_2010_04_22__11_30_1287.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫行为数据,遵循蠕虫行为数据交换标准
- 文件名称:ocr-3 (ok1557) on food L_2010_04_22__11_30_1287.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储原始追踪数据,包含线虫运动的时间序列、骨架分割信息等基础数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ocr-3基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 神经行为学实验: 研究线虫在特定培养基上的运动模式、趋性反应等行为特征
- 生物图像追踪算法验证: 基于tierpsy软件的追踪数据,验证或优化线虫行为追踪算法
- 行为数据库补充: 作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持大规模行为数据的整合分析