数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)DR62品系daf-7(m62)III基因突变体的行为实验数据,属于C.elegans行为数据库的一部分。实验记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为,包含视频追踪数据及特征提取结果,支持线虫行为与基因功能关联分析。
文件详解
- 行为数据压缩文件:
- 文件名称:daf-7 (m62)III on food R_2010_07_29__12_57_1587.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据(wcon格式),记录线虫运动轨迹的时序信息
- 特征提取文件:
- 文件名称:daf-7 (m62)III on food R_2010_07_29__12_57_1587_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,涵盖运动、姿态等量化指标
- 核心数据文件:
- 文件名称:daf-7 (m62)III on food R_2010_07_29__12_57_1587.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验核心数据,如26890个分段骨架数据、时间戳、像素与微米映射关系等基础参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析daf-7基因对秀丽隐杆线虫行为表型的调控作用
- 行为生物学实验:研究成年线虫在食物环境中的运动模式、觅食行为特征
- 生物图像分析算法验证:基于tierpsy软件输出的特征数据,优化线虫行为追踪算法
- 基因-行为关联分析:结合基因突变信息与行为数据,探索神经调控机制
- 模式生物标准实验参考:为同类线虫行为实验提供标准化数据格式及参数参考