数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫NL1142品系(基因型gpa-8(pk345)V)的行为实验记录,属于线虫行为数据库的一部分。实验记录了成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基、OP50食物条件下的行为数据,包含视频追踪特征、运动参数等结构化信息,可用于研究该基因型线虫的行为表型特征。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:
gpa-8 (ph345)V on food R_2009_07_14__12_02__7.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的基础数据,包含视频原始追踪信息、时间序列运动记录等核心实验数据
- 文件名称:
gpa-8 (ph345)V on food R_2009_07_14__12_02__7_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的线虫骨架分段(共6595个)、运动参数等分析特征
- 文件名称:
gpa-8 (ph345)V on food R_2009_07_14__12_02__7.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为线虫行为数据交换格式(wcon)文件,用于存储标准化的行为轨迹数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-8(pk345)突变体线虫的行为表型,探究该基因对运动行为的调控作用
- 行为学实验方法验证: 基于标准化实验协议(E. Yemini et al.方法),验证线虫行为实验的可重复性
- 生物行为特征提取算法测试: 以tierpsy软件提取的特征数据为基础,优化或比较线虫行为特征提取算法
- 基因型与表型关联分析: 关联NL1142品系的基因型信息与行为数据,研究基因变异对生物行为的影响机制