数据集概述
本数据集为《西印度洋侏儒壁虎属（壁虎科）系统发育》论文的配套数据，包含基因序列比对文件、元数据表、物种界定分析结果及标本原色照片压缩包，支持单基因/多基因系统发育推断与ASAP单基因座物种界定研究。
文件详解
- 基因序列比对文件（FAS格式）：
- LygIs_16S_ASAP_aligned_2023-02-28.fas：16S基因ASAP分析比对序列
- LygIs_nd2_capensis_2022-07-25_aligned.fas：ND2基因capensis类群比对序列
- LygIs_rag1V_capensis_group_aligned_2023-01-16.fas：rag1V基因capensis类群比对序列
- LygIs_nd2_ASAP_aligned_2023-02-28.fas：ND2基因ASAP分析比对序列
- LygIs_16S_verticillatus_aligned_2022-08-22.fas：16S基因verticillatus类群比对序列
- LygIs_rag1B_capensis_group_aligned_2023-01-16.fas：rag1B基因capensis类群比对序列
- 多基因分析文件（NEX格式）：
- LygIs_multigene_insularis_2022-08-22.nex：多基因系统发育分析比对序列
- 元数据文件（XLSX格式）：
- LygIs_table_with_all_sequences.xlsx：含所有序列及相关元数据的表格
- 物种界定结果文件（SVG格式）：
- LygIs_16S_ASAP_aligned_2023-02-28.tab.groups.svg：16S基因ASAP分析分组结果
- LygIs_nd2_ASAP_aligned_2023-02-28.tab.groups.svg：ND2基因ASAP分析分组结果
- 补充材料文件（PDF格式）：
- Roell_Lygodactylus_insularis_Supplementary_Materials.pdf：研究补充材料
- 标本照片压缩包（ZIP格式）：
- Roell_Lygodactylus_Indian_Ocean_original_pictures_specimens_in_life.zip：侏儒壁虎标本原色照片
适用场景
- 爬行动物系统发育研究：用于分析西印度洋侏儒壁虎属的演化关系
- 物种界定分析：基于ND2/16S基因序列进行ASAP单基因座物种界定
- 生物多样性研究：支持西印度洋区域侏儒壁虎物种多样性评估
- 形态学与分子数据关联分析：结合标本原色照片与基因数据开展整合研究
- 进化生物学教学：作为系统发育分析实验的教学案例数据
