数据集概述
本数据集聚焦南美原驼(Lama guanicoe)的种群遗传学与系统地理学研究,包含样本信息、微卫星数据、线粒体DNA序列及单倍型数据、补充表格等5个文件。所有文件位于同一目录,无子目录结构,未区分训练/测试集、原始/处理数据,无标签拆分。数据旨在揭示安第斯高原对原驼遗传结构的影响,为物种保护与管理提供科学依据。
文件详解
- 样本信息文件
- 文件名称:
Samples_information.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含314个原驼样本的基本信息,涉及17个采样地点(分布于秘鲁、玻利维亚、阿根廷、智利),可能包括样本编号、地理位置、采样时间等信息
- 微卫星数据文件
- 文件名称:
Microsat_dates.pop
- 文件格式:POP
- 字段映射介绍:存储14个双亲遗传微卫星标记的基因分型数据,用于种群遗传结构分析,包含样本个体的基因型信息
- 线粒体DNA序列文件
- 文件名称:
FinalSeq.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:包含514 bp的线粒体DNA序列数据,用于系统地理学和种群历史分析,采用NEXUS格式存储
- 单倍型数据文件
- 文件名称:
FinalHap.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:存储线粒体DNA单倍型数据,用于分析种群间的遗传分化和基因流模式,采用NEXUS格式存储
- 补充表格文件
- 文件名称:
Supplementary Table.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含研究的补充表格信息,可能涉及遗传分析结果、统计数据、地理分布等辅助信息
数据来源
论文“The influence of the arid Andean high plateau on the phylogeography and population genetics of guanaco (Lama guanicoe) in South America”
适用场景
- 原驼种群遗传结构分析:利用微卫星数据和线粒体DNA序列,解析不同地理种群的遗传分化程度和基因流模式
- 系统地理学研究:通过单倍型数据,重建原驼的种群历史动态,揭示安第斯高原对物种演化的影响
- 保护生物学应用:为原驼的保护与管理提供科学依据,指导制定针对性的保护策略
- 生物地理学研究:分析地理屏障(如安第斯高原)对物种遗传结构的塑造作用,探讨物种适应性进化机制