数据集概述
本数据集为论文“Impact of medication on blood transcriptome reveals off-target regulations of beta-blockers”的统计摘要数据,包含LIFE-Adult和LIFE-Heart两个研究中,药物对血液转录组影响的探针水平统计结果,涉及探针编号、log折叠变化、标准误、p值、q值、关联活性物质及基因信息等内容,以压缩CSV文件形式提供。
文件详解
- 文件名称:220316_neu7_LIFE_ADULT_HEART_all.zip
- 文件格式:ZIP(包含CSV文件)
- 字段映射介绍:CSV文件包含以下字段:
- identifier:探针编号及关联活性物质
- PROBE_ID.Adult:LIFE-Adult研究的探针编号
- logFC.Adult:LIFE-Adult研究中探针的log折叠变化
- SE.Adult:LIFE-Adult研究中探针的标准误
- P.Value.Adult:LIFE-Adult研究中探针的p值
- qval.Adult:LIFE-Adult研究中探针的q值
- medi.Adult:LIFE-Adult研究中关联的活性物质
- P.Value.Heart:LIFE-Heart研究中探针的p值
- logFC.Heart:LIFE-Heart研究中探针的log折叠变化
- SE.Heart:LIFE-Heart研究中探针的标准误
- qval.Heart:LIFE-Heart研究中探针的q值
- medi.Heart:LIFE-Heart研究中关联的活性物质
- symbol_INGENUITY:Ingenuity数据库中探针关联的基因符号
- description_INGENUITY:Ingenuity数据库中探针关联基因的描述
数据来源
论文“Impact of medication on blood transcriptome reveals off-target regulations of beta-blockers”
适用场景
- 药物作用机制研究:分析β受体阻滞剂等药物对血液转录组的靶向及脱靶调控效应
- 转录组数据分析:基于探针水平的logFC、p值等统计量,挖掘药物相关的差异表达基因
- 医学研究数据验证:验证LIFE-Adult和LIFE-Heart两个队列中药物对转录组影响的一致性
- 基因功能注释研究:结合Ingenuity数据库的基因信息,探索药物影响的生物学通路及功能模块