药物活性预测多标签分类数据集DrugActivityPredictionMulti-labelClassificationDataset-itsuki9180
数据来源:互联网公开数据
标签:药物研发, 靶点预测, 多标签分类, 生物信息学, 药物筛选, 机器学习, 深度学习, 基因表达
数据概述:
该数据集包含药物活性预测的多标签分类数据,涉及药物对多种生物靶点的作用。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注具体时间,可视为静态数据集。
地理范围:数据来源于药物研发领域,未限定具体地理范围,具有通用性。
数据维度:数据集主要包含两个关键部分:
基因表达数据:使用.npy格式存储,包括ae_cells_train.npy、ae_cells_test.npy、ae_genes_train.npy和ae_genes_test.npy,分别代表细胞和基因的训练集和测试集,用于自编码器(AE)模型的训练和评估。
药物活性预测标签:以submission.csv文件形式提供,包含sig_id(药物ID)以及多种药物对不同靶点的预测活性标签,标签为多标签分类,每个药物可能具有多个活性。
数据格式:数据主要包括.npy格式(用于存储数值型数据,如基因表达数据)和CSV格式(用于存储结构化数据,如药物活性预测标签),便于数据分析和模型构建。
来源信息:数据来源可能为公开的药物研发竞赛或公开数据集,具体来源未在数据集中明确说明,但数据已进行预处理,适用于直接进行模型训练。
该数据集适合用于药物活性预测、靶点识别和多标签分类等研究,也可用于评估和比较不同的机器学习和深度学习模型。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于药物研发、生物信息学和机器学习交叉领域的学术研究,例如药物靶点预测、药物组合效应分析、多标签分类算法的评估等。
行业应用:可以为制药公司、生物技术公司提供数据支持,特别是在药物筛选、药物研发流程优化、个性化医疗等领域。
决策支持:支持药物研发过程中的靶点选择、药物设计和临床试验决策,提高研发效率和成功率。
教育和培训:作为生物信息学、机器学习和药物研发等相关课程的实训素材,帮助学生和研究人员深入理解药物作用机制,掌握多标签分类模型的应用。
此数据集特别适合用于探索药物与生物靶点的相互作用关系,构建药物活性预测模型,并实现对药物筛选流程的优化和加速。