数据集概述
本数据集包含特立尼达孔雀鱼雄性色彩模式的感官量化数据及相关遗传数据,用于研究其表型进化是否存在平行性。数据结合了色彩表型测量(基于孔雀鱼和捕食者视觉系统)、群体遗传结构分析(SNP数据),验证低捕食环境下孔雀鱼色彩表型的适应性进化模式,共含9个文件。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称:YONG_etal_2021_ReadME_File.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集概述、作者信息等元数据
- 色彩表型数据
- 文件名称:color_data_means_guppy_cren_sdu_mod.txt、official_molecol_colour_data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:基于孔雀鱼和捕食者视觉系统的色彩表型均值数据
- 遗传数据
- 文件名称:SNP_all_LGsonly_50k_pool_40.txt、male_geno_files.zip、official_combined_fst_stats_mean_matrix.txt
- 文件格式:TXT、ZIP
- 字段映射介绍:SNP位点数据、基因型文件压缩包、群体间Fst统计矩阵
- 表型差异矩阵
- 文件名称:Zmatrix_amonglineage_all_vision.txt、Zmatrix_amonglineage_cichlid_vision.txt、Zmatrix_amonglineage_guppy_vision.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:基于不同视觉系统的谱系间表型差异矩阵
数据来源
论文“Sensory-based quantification of male colour patterns in Trinidadian guppies reveals no support for parallel phenotypic evolution in multivariate trait space”
适用场景
- 进化生物学研究:分析孔雀鱼色彩表型在不同捕食环境下的进化模式
- 感官生态学分析:基于物种视觉系统的表型量化方法应用
- 群体遗传学研究:利用SNP数据和Fst统计分析群体遗传结构
- 表型-基因型关联分析:探索色彩表型差异与遗传变异的关系
- 适应性进化验证:检验低捕食环境下孔雀鱼色彩表型的平行进化假说