数据集概述
该数据集包含亲和纯化质谱(AP-MS)实验和活细胞成像的原始及处理文件,用于表征U2OS细胞中KIAA1671和KIAA1143的相互作用组和细胞动力学,为有丝分裂调节机制研究提供数据支持。
文件详解
- AP-MS蛋白质组学数据
- KIAA1143_and_KIAA1671_proteomics.zip:ZIP格式,包含过表达GFP标记KIAA1671或KIAA1143的U2OS野生型细胞的原始蛋白质组学数据(如光谱计数、肽段信息、蛋白质ID)
- KIAA1671_CDK_AS_proteomics.zip:ZIP格式,包含表达KIAA1671-GFP的U2OS CDK1^AS细胞系的原始蛋白质组学数据,用于比较化学同步条件下KIAA1671的有丝分裂相互作用因子
- 污染物过滤与相互作用评分文件
- CRAPOME Excel.xlsx:XLSX格式,包含CRAPOME输出的过滤后AP-MS数据,移除常见污染物并基于SAINT算法对高置信度相互作用因子排名
- 活细胞成像数据
- KIAA1671-GFP_H2B Cells movies.zip:ZIP格式,包含表达KIAA1671-GFP和H2B的U2OS细胞活细胞成像视频,用于观察细胞周期中核和中心体动态
- KIAA1143-GFP_movie.zip:ZIP格式,包含GFP标记KIAA1143在活U2OS细胞中的定位和动态行为的延时视频
适用场景
- 细胞生物学研究:分析KIAA1671和KIAA1143在有丝分裂中的相互作用网络及细胞动力学机制
- 蛋白质组学分析:验证AP-MS实验中鉴定的蛋白质相互作用,筛选高置信度有丝分裂调节因子
- 分子生物学实验:基于活细胞成像数据研究核与中心体在细胞周期中的动态变化规律
- 有丝分裂机制研究:探究CDK1^AS条件下KIAA1671的有丝分裂特异性相互作用因子功能