数据集概述
本数据集包含原发性中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）及相关亚型的基因组与转录组分析数据，涉及体细胞拷贝数变异、插入缺失、基因突变等分子层面信息，以及研究论文的原始图片文件，为理解PCNSL的分子机制提供数据支持。
文件详解
- 基因组变异数据文件（TSV格式）：
- Radke_et_al_supplementary_somatic_CNVs.tsv：ACEseq预测的体细胞拷贝数变异数据
- Radke_et_al_supplementary_somatic_indels.tsv：DKFZ platypus流程预测的体细胞插入缺失数据
- Radke_et_al_supplementary_somatic_indels_exonic.tsv：DKFZ platypus流程预测的外显子区体细胞插入缺失数据
- Radke_et_al_supplementary_somatic_mutations_integrated.tsv：基因-患者突变矩阵表，记录观察到的突变情况
- Radke_et_al_supplementary_somatic_mutations_integr_integrated_including_kataegis_counts.tsv：含kataegis热点突变计数的基因-患者突变矩阵表
- Radke_et_al_supplementary_somatic_SNVs.tsv：DKFZ mpileup流程预测的体细胞单核苷酸变异数据
- Radke_et_al_supplementary_somatic_SNVs_exonic_functional.tsv：DKFZ mpileup流程预测的外显子区功能性体细胞单核苷酸变异数据，包含PID、CHROM、POS、GENE等字段
- Radke_et_al_supplementary_somatic_SNVs_rescued_by_TiNDA.tsv：TiNDA模型校正后的体细胞单核苷酸变异数据，包含ANNOVAR_FUNCTION、EXONIC_CLASSIFICATION等字段
- Radke_et_al_supplementary_somatic_SVs.tsv：DKFZ Sophia流程预测的体细胞结构变异数据
- Radke_et_al_supplementary_RNAseq_numReads_CNSLs.tsv：DKFZ RNAseq流程计算的RNA测序读段计数数据
- 原始图片文件：
- 包含12个TIFF格式图片（如Radke_et_al_Main_Figure_1c_BCL6.tif、Radke_et_al_Supplementary_Figure_1a_CD20.tif等）：研究论文的主要图表及补充图表原始图像
- 2个JPG格式图片（Radke_et_al_Supplementary_Figure_1c_CDKN2A_FISH_1.jpg等）：FISH实验结果原始图像
- 1个PPTX格式文件（Radke_et_al_Supplementary_Figure_1b_EBV_PCR.pptx）：EBV PCR实验结果原始文件
适用场景
- 肿瘤基因组学研究：分析PCNSL的体细胞突变谱、拷贝数变异及结构变异特征
- 分子病理学研究：探究EBV阳性/阴性CNSL及继发性CNSL的分子差异
- 比较肿瘤学研究：对比CNSL与系统性弥漫大B细胞淋巴瘤的基因组差异
- 转化医学研究：为PCNSL的靶向治疗靶点发现提供分子数据支持
- 生物信息学方法验证：评估不同变异检测流程（如ACEseq、platypus）在淋巴瘤样本中的表现
