数据集概述
本数据集围绕两种数字PCR平台（Bio-Rad QX200和QIAGEN QIAcuity One）在原生生物基因拷贝数定量中的精度对比展开，包含实验数据、分析代码及结果文件，为评估数字PCR技术在环境微生物监测中的应用提供支持。
文件详解
- 实验数据文件：
- GC_ndPCR_synth_gene_dil.txt：文本格式，包含合成基因稀释实验的基因拷贝数测量数据，字段包括样本名称、估计浓度、阳性分区数等
- ndPCR_ddPCR_dilution.txt：文本格式，记录数字PCR稀释实验的相关数据
- ndPCR_ddPCR_ciliate_cellnumbers.csv：CSV格式，包含纤毛虫细胞数量与基因拷贝数定量结果，字段包括cellnumber（细胞数）、copynumber_per_uL（每微升拷贝数）、Technique（技术平台）、RE（限制性内切酶）等
- ndPCR_ddPCR_cv.csv：CSV格式，记录不同细胞数下的拷贝数变异系数数据，字段包括cellnumber、copynumber（拷贝数）、cv（变异系数）、Technique、RE等
- GC_ddPCR_synth_gene_dil.txt：文本格式，包含ddPCR平台合成基因稀释实验的数据
- 分析代码文件：
- R-code.pdf：PDF格式，记录实验数据分析所用的R语言代码
适用场景
- 分子生物学研究：对比不同数字PCR平台在基因拷贝数定量中的精度与 reproducibility
- 环境监测应用：评估数字PCR技术在原生生物等微生物丰度检测中的适用性
- 实验方法优化：分析限制性内切酶对基因拷贝数定量结果的影响
- 微生物生态学研究：支持基于基因拷贝数的原生生物动态变化监测
