数据集概述
本数据集为G14R α-突触核蛋白原纤维的冷冻电镜分析提供关键资源支持,包含实验所用数据集、软件及协议的资源表、野生型与G14R变体原纤维的原丝分布数据、冷冻电镜密度图分辨率相关的傅里叶壳层相关(FSC)数据及可视化脚本,共7个文件。
文件详解
- 资源表文件
- 文件名称:Key_ressource_table_G14R.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含冷冻电镜分析中使用的所有数据集、软件和实验协议的综合列表
- 原丝分布数据文件
- 文件名称:Protofilament_distribution.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录野生型(WT)和G14R α-突触核蛋白原纤维的原丝分布统计数据
- FSC数据文件
- 文件名称:G14R_postprocess_fsc.xml、WT_postprocess_fsc.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:存储各密度图分辨率测定的傅里叶壳层相关(FSC)图表数据,由RELION 4.0生成
- FSC可视化脚本
- 文件名称:WT_FSC_plot.py、G14R_FSC_plot.py
- 文件格式:PY
- 字段映射介绍:用于从FSC XML数据生成可视化图表的Python脚本,支持分辨率测定结果的展示
- 说明文档
- 文件名称:READ.ME_G14R.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含数据集使用说明、文件说明及联系信息的文档
数据来源
Zenodo平台,关联论文“A Novel Alpha-Synuclein G14R Missense Variant is Associated with Atypical Neuropathological Features”
适用场景
- 神经病理学研究:分析G14R α-突触核蛋白变体的病理特征及与野生型的差异
- 冷冻电镜数据处理:参考实验所用软件、协议及分辨率测定方法,优化类似结构解析流程
- 蛋白质结构分析:基于原丝分布数据研究α-突触核蛋白原纤维的组装机制
- 生物信息学可视化:利用FSC脚本复现或扩展冷冻电镜分辨率数据的可视化分析
- 实验方法参考:为相关蛋白质冷冻电镜分析提供标准化资源列表与操作规范