数据集概述
本数据集包含认知老化大鼠模型中蛋白质结构变化相关的肽定量数据。研究通过有限水解质谱技术分析老年认知保留与认知受损大鼠的海马体可溶性蛋白，识别认知相关结构变化蛋白，并探究其与蛋白复性能力的关系。数据集提供9个Excel格式的肽定量文件及1个预处理代码文件，共10个文件。
文件详解
- 肽定量数据文件（共9个）
- 文件名称：Zenodo_Peptide_CA3_CASC.xlsx、Zenodo_Peptide_DG_sCASC.xlsx、Zenodo_Peptide_CA1_CASC.xlsx、Zenodo_Peptide_CA1_sCASC.xlsx、Zenodo_Refold_Peptide_2hr.xlsx、Zenodo_Peptide_DG_CASC.xlsx、Zenodo_Refold_Peptide_5min.xlsx、Zenodo_Peptide_CA3_sCASC.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含LC-MS/MS蛋白质组学实验的处理后肽定量数据，按海马体亚区（CA1、CA3、DG）、认知相关结构变化类型（CASC、sCASC）及复性实验时间点（5min、2hr）分类
- 预处理代码文件（1个）
- 文件名称：prefilter_impute_ion.ipynb
- 文件格式：IPYNB
- 字段映射介绍：包含肽定量数据的预过滤、缺失值插补及离子处理相关的代码脚本
数据来源
Zenodo平台（基于研究论文数据）
适用场景
- 认知老化蛋白质组学分析：研究老年大鼠海马体不同亚区认知相关蛋白质的结构变化及肽定量特征
- 蛋白复性能力研究：分析认知相关结构变化蛋白的复性效率与认知功能的关联
- 蛋白质组学数据预处理：参考预过滤、插补代码优化肽定量数据的分析流程
- 认知衰退机制研究：探究非淀粉样蛋白结构变化在年龄相关认知能力下降中的作用
- 神经退行性疾病靶点筛选：识别与认知老化相关的潜在蛋白质靶点
