数据集概述
本数据集聚焦蚱蜢近期辐射演化中通过融合形成新物种的基因组证据,验证分类有争议的蚱蜢Chorthippus saulcyi algoaldensis是否为C. binotatus与C. saulcyi的杂交后代,涉及基因组与表型数据,含8个文件,支持物种形成机制研究。
文件详解
- README.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:数据集说明文档,通常包含研究背景、数据采集方法、文件清单及使用说明等基础信息
- 00_Samples.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:样本信息表,可能包含样本编号、物种分类、采集地点等样本基本属性
- 01_FASTSTRUCTURE_DAPC.str
- 文件格式:STR
- 字段映射介绍:遗传聚类分析数据文件,用于FASTSTRUCTURE和DAPC分析的输入数据,包含样本基因型数据
- 02_SVDQuartets.unlinked_snps.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:SVDQuartets分析数据文件,基于非连锁SNPs的系统发育分析输入数据
- 03_SNAPP.unlinked_snps.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:SNAPP分析数据文件,基于非连锁SNPs的贝叶斯系统发育分析输入数据
- 04_Dstatistics.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:D统计分析压缩包,包含用于检测基因流的D统计相关数据及结果
- 05_FASTSIMCOAL2.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:FASTSIMCOAL2分析压缩包,包含基于溯祖模拟的种群 demographic 分析数据及结果
- 06_Morphology.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:形态学数据压缩包,包含蚱蜢表型测量数据及相关分析结果
数据来源
论文“Genomic evidence of speciation by fusion in a recent radiation of grasshoppers”
适用场景
- 物种形成机制研究: 分析蚱蜢通过杂交融合形成新物种的基因组证据,验证杂交物种形成假说
- 遗传聚类分析: 利用FASTSTRUCTURE和DAPC数据研究蚱蜢种群遗传结构与分化
- 系统发育分析: 通过SVDQuartets和SNAPP数据构建蚱蜢物种系统发育树,明确分类地位
- 基因流检测: 基于D统计数据探究蚱蜢物种间基因流模式与强度
- 种群动态模拟: 利用FASTSIMCOAL2数据模拟种群历史动态,揭示物种形成的时间与过程
- 表型与基因型关联分析: 结合形态学与基因组数据,研究蚱蜢表型(如食性)与基因型的关联机制