数据集概述
本数据集聚焦兰科掌裂兰属的进化研究，通过基因组位点数据解析二倍体物种的界定与关系，分析16个异源四倍体与潜在亲本二倍体的关联，推断杂交方向、相对年龄及分布特征，为多倍体植物复合体进化研究提供数据支持。
文件详解
- 数据文件：
- SupplementaryTables.xlsx：Excel格式，包含补充表格数据
- snapp.trees：系统发育树文件
- SFigure1.phy.txt：文本格式，图1相关的系统发育数据
- PolyRel_2x.txt：文本格式，二倍体相关数据，含基因型等字段（如Ind、Pop、l1-l17等）
- Figure3.phylip.txt：文本格式，图3相关的系统发育数据
- PolyRel_4x.txt：文本格式，四倍体相关数据，含配置参数及基因型等字段
- PolyRel_all.txt：文本格式，所有样本相关数据
- 文档与配置文件：
- SFigures.pdf：PDF格式，补充图表文档
- pipeline.txt：文本格式，分析流程说明
- snapp_Mar.xml：XML格式，系统发育分析配置文件
- bfd_inc.xml：XML格式，分析配置文件
- bfd_fuc.xml：XML格式，分析配置文件
适用场景
- 植物系统发育研究：解析掌裂兰属二倍体物种界定与亲缘关系
- 多倍体进化分析：探究异源四倍体的亲本来源、杂交方向及相对年龄
- 生物地理学研究：分析掌裂兰属多倍体的分布特征与气候历史的关联
- 生物信息学方法验证：测试多倍体复合体基因组数据分析方法的有效性
