爪蟾科蛙类系统发育基因组数据集

数据集概述

本数据集是关于爪蟾科(Pipa、Hymenochirus、Silurana、Xenopus属)蛙类的系统发育基因组研究数据,包含113个常染色体编码区及部分线粒体基因组的序列数据,用于解决其进化关系与分化时间估计的挑战。

文件详解

  • 系统发育分析文件(XML格式):
  • pipandroot_hky.xml、rootonly_hky.xml、piponly_jc.xml、piponly_gtr.xml、rootonly_gtr.xml、rootonly_jc.xml、piponly_hky.xml等共9个XML文件:可能为不同进化模型(如HKY、JC、GTR)下的系统发育分析配置或结果文件。
  • 分析输入文件(.in格式):
  • BEST_pipid_GTR_114.in、BEST_pipid_JC_114.in、BEST_pipid_HKY_114.in共3个.in文件:可能为多基因座合并方法分析的输入参数文件。
  • 补充信息文件(PDF格式):
  • Suppl_Info.pdf:PDF格式文档,可能包含数据集的补充方法、结果或说明信息。

适用场景

  • 分子系统学研究:分析爪蟾科蛙类的进化关系与分化时间。
  • 进化生物学研究:探究基因谱系不一致、重复替换等进化过程特征。
  • 生物地理学研究:结合地质记录分析冈瓦纳大陆分裂对爪蟾科蛙类多样化的影响。
  • 系统发育方法验证:测试多基因座合并方法在解决复杂系统发育问题中的有效性。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 14.71 MiB
最后更新 2025年12月18日
创建于 2025年12月18日
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