真菌分离株培养性能基因标记转录组数据

数据集概述

本数据集包含四种真菌分离株(Chalara longipes、Laccaria bicolor、Serpula lacrymans、Trichoderma harzianum)的培养性能、基因标记及转录组数据。通过在不同氮可用性的液体培养基中培养真菌,测量生长速率和呼吸以计算碳利用效率,关联基因标记表达与碳通量,识别出1,3-β-葡聚糖合酶基因(生长标记)和2-酮戊二酸脱氢酶基因(呼吸标记),构建的基因表达指数与碳利用效率显著相关。

文件详解

  • 文件名称:Culture_performance-Gene_marker.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含真菌在不同氮可用性液体培养基中的培养性能数据,如生长速率、呼吸速率、碳利用效率,以及1,3-β-葡聚糖合酶基因(生长标记)和2-酮戊二酸脱氢酶基因(呼吸标记)的表达数据。
  • 文件名称:Transcriptome.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含四种真菌分离株的转录组数据,记录基因表达模式,用于关联基因表达与代谢过程、碳利用效率等表型特征。

适用场景

  • 真菌代谢研究:分析不同氮可用性条件下真菌的碳利用效率及代谢过程。
  • 基因标记应用:利用1,3-β-葡聚糖合酶和2-酮戊二酸脱氢酶基因标记评估真菌生长与呼吸。
  • 转录组关联分析:通过转录组数据预测真菌表型,探究基因表达与碳通量的关系。
  • 生物地球化学建模:为真菌碳利用效率相关的生物地球化学模型提供数据支持。
  • 自然真菌群落研究:支持利用宏转录组或RT-qPCR方法评估自然真菌群落的生长、呼吸及碳利用效率差异。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.4 MiB
最后更新 2026年2月15日
创建于 2026年2月15日
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