真菌雷达手稿代码与数据1_1

数据集概述

本数据集为手稿“土地利用驱动真菌病原体耐药性空间结构”的配套代码与数据,包含原始CSV数据、TIFF空间文件、R语言分析脚本及中间文件,支持耐药性数据的空间分析与图表生成。

文件详解

  • 原始数据文件:
  • Schimmelradar_360_submission.csv:CSV格式,含空气样本表型耐药性空间数据,字段包括样本编号、区域、采样日期、唑类药物耐药率、经纬度等
  • Analysis_genotyping_schimmelradar_TR_types.csv:CSV格式,含耐药菌株基因型数据,字段包括串联重复类型、唑类药物、样本编号、cyp51a启动子突变类型等
  • 空间数据文件:
  • LGN2022.tif、Gewas22rast.tiff:TIFF格式,来自LGN.nl和PDOK.nl的土地利用栅格数据
  • Predictor_raster_NL.tif:TIFF格式,整合后的土地利用与气象预测因子栅格
  • R语言脚本文件:
  • Script_1_generation_100_equisized_areas_NL.Rmd:生成荷兰一百个等面积区域的脚本
  • Script_2_Spatial_data_integration_fungalradar.Rmd:整合表型/基因型数据与空间数据的脚本
  • Script_2B_pairwise_correlations.R:分析耐药性与基因型相关性的脚本
  • 共十类R脚本文件,覆盖空间模型构建、耐药性分析等功能
  • 中间文件:
  • Schimmelradar360spat_focal.RData等RData格式文件:整合后的空间数据对象
  • qualified_models_*.csv:模型选择结果的CSV文件
  • relative_fungicide_intensity.tif:真菌icide强度栅格文件

适用场景

  • 微生物学研究:分析真菌病原体耐药性的空间分布特征
  • 环境科学研究:探究土地利用对耐药真菌空间结构的驱动作用
  • 生物信息学分析:复现手稿中的耐药基因型与表型关联分析
  • 空间统计学应用:验证土地利用-耐药性空间模型的构建方法
  • 公共卫生研究:评估环境因素对真菌耐药性传播的影响
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 985.92 MiB
最后更新 2025年12月12日
创建于 2025年12月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。