数据集概述
本数据集为手稿“土地利用驱动真菌病原体耐药性空间结构”的配套代码与数据,包含原始CSV数据、TIFF空间文件、R语言分析脚本及中间文件,支持耐药性数据的空间分析与图表生成。
文件详解
- 原始数据文件:
- Schimmelradar_360_submission.csv:CSV格式,含空气样本表型耐药性空间数据,字段包括样本编号、区域、采样日期、唑类药物耐药率、经纬度等
- Analysis_genotyping_schimmelradar_TR_types.csv:CSV格式,含耐药菌株基因型数据,字段包括串联重复类型、唑类药物、样本编号、cyp51a启动子突变类型等
- 空间数据文件:
- LGN2022.tif、Gewas22rast.tiff:TIFF格式,来自LGN.nl和PDOK.nl的土地利用栅格数据
- Predictor_raster_NL.tif:TIFF格式,整合后的土地利用与气象预测因子栅格
- R语言脚本文件:
- Script_1_generation_100_equisized_areas_NL.Rmd:生成荷兰一百个等面积区域的脚本
- Script_2_Spatial_data_integration_fungalradar.Rmd:整合表型/基因型数据与空间数据的脚本
- Script_2B_pairwise_correlations.R:分析耐药性与基因型相关性的脚本
- 共十类R脚本文件,覆盖空间模型构建、耐药性分析等功能
- 中间文件:
- Schimmelradar360spat_focal.RData等RData格式文件:整合后的空间数据对象
- qualified_models_*.csv:模型选择结果的CSV文件
- relative_fungicide_intensity.tif:真菌icide强度栅格文件
适用场景
- 微生物学研究:分析真菌病原体耐药性的空间分布特征
- 环境科学研究:探究土地利用对耐药真菌空间结构的驱动作用
- 生物信息学分析:复现手稿中的耐药基因型与表型关联分析
- 空间统计学应用:验证土地利用-耐药性空间模型的构建方法
- 公共卫生研究:评估环境因素对真菌耐药性传播的影响