数据集概述
本数据集为植物内源性靶标模拟物（eTMs）数据库PeTMbase的结构化数据文件集合，包含11种植物的miRNA:eTM调控模块信息，涵盖eTM与miRNA的序列、结合位点等核心数据，为植物miRNA调控网络研究提供支持。
文件详解
- 数据集包含11个CSV格式文件，以植物物种缩写命名，例如：
- bdi.csv：二穗短柄草相关eTM数据
- gma.csv：大豆相关eTM数据
- gma.csv、mtr.csv、sbi.csv、tae.csv、ath.csv、ptr.csv、zma.csv等（共11个物种文件）
- 每个CSV文件的核心字段包括：
- eTMID：eTM唯一标识符
- TranscriptID：转录本ID
- TranscriptSequence：转录本序列
- microRNAReverseComplementerySequence：miRNA反向互补序列
- BindingStartsite：结合起始位点
- BindingEndSite：结合终止位点
- mirBaseId：miRBase数据库中的miRNA ID
- microRNASequence：miRNA序列
适用场景
- 植物分子生物学研究：分析miRNA-eTM-mRNA调控模块的功能机制
- 非编码RNA功能研究：探究lncRNA作为eTM在植物中的调控作用
- 作物分子育种：挖掘与重要农艺性状相关的miRNA:eTM模块
- 植物基因组学分析：构建植物miRNA调控网络的核心数据支撑
