数据集概述
本数据集为期刊文章的补充材料,围绕植物RNA聚合酶II大亚基(RPB1)基因中的G-四链体(G4)展开,包含序列分析、结构预测、实验验证等多维度数据,支持对该保守元件功能与进化的研究。
文件详解
- Supplementary material S1_G4-forming sequences and scores.xlsx:Excel格式,含40种植物RPB1序列特征及4种计算方法的G4预测结果
- Supplementary material S2_G4 locus is the most conserved within RPB1 gene.PNG:PNG格式,展示RPB1基因中G4位点的保守性直方图与位置标注
- Supplementary material S3_Multiple alignment of RPB1 paralogs G4 locus in Arabidopsis.png:PNG格式,拟南芥RPB1旁系同源基因G4位点的多序列比对图
- Supplementary material S4_Modelled 3D structure of G4 from Bathycoccus prasinos.tar.gz:压缩包格式,含Bathycoccus prasinos G4的3D结构模型(PDB格式)
- Supplementary material S5_Gel electrophoresis and ThT staining.docx:Word格式,选定G4形成序列的凝胶电泳与ThT染色实验数据
- Supplementary material S6_All analyzed RPB1 sequences in FASTA format.fasta:FASTA格式,所有分析的RPB1序列原始数据
- Supplementary material S7_RPB1 aligned sequences all.txt:TXT格式,比对后的RPB1序列(FASTA格式)
- Supplementary material S8_RPB1 paralogs in Arabidopsis .txt:TXT格式,拟南芥RPB1旁系同源基因序列
- Supplementary material S9_Spectral composition of light used in the UV experiment.tif:TIFF格式,UV实验所用光源的光谱成分分析图
- Supplementary material S10_Difference CD spectra - comparison without and with previous UV treatment.pdf:PDF格式,UV处理前后的圆二色谱差异对比数据
适用场景
- 植物分子生物学研究:分析RPB1基因中G4结构的进化保守性
- 核酸结构生物学研究:验证G4序列的形成能力与结构特征
- 光生物学实验设计:参考UV实验的光源光谱参数
- 生物信息学分析:利用FASTA序列开展同源性比对与结构预测