数据集概述
本数据集围绕植物有性与无性繁殖对种子微生物组的贡献展开，包含微生物组组成、来源追踪结果、样本映射关系及分析代码等10个文件，覆盖biom、xlsx、txt、R等格式，为研究植物繁殖方式对种子微生物组的影响提供数据支持。
文件详解
- 微生物组数据文件
- 文件名称：final_otu_table_minus_contaminants.biom
- 文件格式：BIOM
- 字段映射介绍：去污染后的最终OTU（操作分类单元）表，包含样本的微生物分类单元组成信息
- 来源追踪结果文件
- 文件名称：Source_tracker_output.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：源追踪分析输出结果，记录不同来源对种子微生物组的贡献情况
- 样本映射文件
- 文件名称：MappingFile.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含SampleID、Tissue（组织）、Time（时间）、Tree（树）、Time2、Tissue2等字段，记录样本的基本信息与分组情况
- 组织水平源贡献矩阵文件
- 文件名称：FEAST_tissue_level_results_T3/4/5/6/7_source_contributions_matrix.txt（共5个文件）
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：不同时间点（T3-T7）组织水平的FEAST源贡献矩阵，记录各来源对微生物组的贡献比例
- 源追踪个体树文件
- 文件名称：Source_tracker_ind_trees.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：源追踪分析中的个体树结果，展示样本间的微生物组来源关系
- 分析代码文件
- 文件名称：MS_micorbal_inheritence_Rcode.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：微生物遗传分析的R代码，用于复现研究中的数据分析过程
适用场景
- 植物繁殖方式与微生物组关系研究: 分析有性与无性繁殖对种子微生物组组成的影响
- 微生物组来源追踪: 利用源追踪结果探究种子微生物组的主要来源
- 植物组织微生物组动态分析: 通过不同时间点的组织水平数据，研究微生物组的时间动态变化
- 微生物组数据分析方法复现: 基于R代码复现研究中的微生物遗传分析过程
- 植物微生物组样本管理: 利用样本映射文件进行样本信息的查询与分组管理
