数据集概述
该数据集包含论文《空间转录组数据的可解释空间梯度分析》中八十七个肿瘤空间转录组（ST）数据集的LSGI处理结果，提供了分析所需的教程文档，支持空间转录组数据的注释与可视化研究。
文件详解
- 核心数据文件（共八十七个）:
- 文件格式: RDS (.rds)
- 命名示例: Gouin2021An_GSM5224027_MIBC_B1204_10xvisium.out.info.rds、berglund2018spatial_berglund2018spatial_ST_prostate_P3.out.info.rds等
- 内容说明: 各肿瘤样本经LSGI处理后的空间转录组数据文件
- 分析教程文件:
- 文件名称: LSGI-annotation-and-visualization-demo.html
- 文件格式: HTML (.html)
- 内容说明: 提供数据集分析的教程文档，支持注释与可视化操作
- 其他辅助文件:
- 包含一个R脚本文件（.r格式）和一个R Markdown文件（.rmd格式），可能用于数据处理或分析流程
适用场景
- 空间转录组学研究: 分析肿瘤组织的空间基因表达梯度特征
- 生物信息学方法验证: 验证LSGI算法在空间转录组数据处理中的效果
- 肿瘤微环境分析: 探究肿瘤组织空间结构与基因表达的关联
- 医学研究: 支持肿瘤相关的空间生物学机制研究
- 生物信息学教学: 作为空间转录组数据处理与可视化的实践案例
