数据集概述
本数据集围绕肿瘤内脆弱拟杆菌对卡培他滨联合纳武利尤单抗治疗敏感性的影响展开,包含结直肠癌患者接受该联合治疗期间的单细胞RNA测序数据及相关分析结果,涉及免疫细胞浸润、基因表达差异等核心内容,为研究治疗敏感性机制提供数据支持。
文件详解
该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下:
- 细胞亚群分析文件(RAR格式):
- Macro_Mono_DC.rar:可能包含巨噬细胞、单核细胞和树突状细胞的分析数据
- Fib_Endo_Results.rar:可能包含成纤维细胞和内皮细胞的分析结果
- All Tcell/T_analysis.rar:T细胞相关分析数据
- 组间差异分析文件:
- Differences between large groups/DC_all-SphK2-high .vs.SphK2-low .VolcanoPlot.pdf:树突状细胞SphK2高低组差异火山图
- Differences between large groups/Endo_SphK2-high.vs.SphK2-low.VolcanoPlot.pdf:内皮细胞SphK2高低组差异火山图
- Differences between large groups/Fib_SphK2-high.vs.SphK2-low.VolcanoPlot.pdf:成纤维细胞SphK2高低组差异火山图
- Differences between large groups/Epi_all-SphK2-high.vs.SphK2-low.VolcanoPlot.pdf:上皮细胞SphK2高低组差异火山图
- Differences between large groups/Mono_Macro_all-SphK2-high.vsSphK2-low.VolcanoPlot.pdf:单核巨噬细胞SphK2高低组差异火山图
- 细胞类型特异性结果文件:
- Epi-result/Epi_Allmarkers.csv:上皮细胞标记基因数据,字段包括p_val、avg_log2FC、pct.1、pct.2、p_val_adj、cluster、gene等
- Epi-result/DotPlot_Epi_Marker.pdf:上皮细胞标记基因点图
- Epi-result/UMAP.pdf:上皮细胞UMAP降维分析图
- Neu_results/Neu_Allmarkers.csv:神经细胞标记基因数据
- NK/NK-SphK2-high .up.GO.csv:NK细胞SphK2高表达组GO富集分析数据
- All Tcell/DEGs/Tcell_all-SphK2-high.vs.SphK2-low.Heatmap.pdf:T细胞SphK2高低组差异基因热图
适用场景
- 肿瘤免疫治疗机制研究:分析脆弱拟杆菌对卡培他滨联合纳武利尤单抗治疗敏感性的调控机制
- 免疫细胞浸润分析:探究不同免疫细胞亚群在治疗中的浸润变化
- 基因表达差异研究:挖掘SphK2高低表达组间的关键差异基因及通路
- 微生物-免疫相互作用研究:探索肿瘤内微生物对免疫治疗效果的影响
- 结直肠癌治疗靶点筛选:基于基因表达差异筛选潜在治疗靶点