数据集概述
本数据集围绕专性蚂蚁寄生虫美洲原颚蚁及其两种宿主物种长刺切胸蚁和弯刺切胸蚁的进化潜力展开。通过微卫星位点和线粒体DNA序列分析,揭示三者的遗传多样性、种群结构及性别特异性扩散模式,为研究寄生-宿主协同进化提供数据支持。
文件详解
- 基因序列文件:
- Tlong50Seqs.fas、Pam_78seqs.fas、Curvi_pops_36Seqs.fas: FAS格式的线粒体DNA序列文件,分别对应长刺切胸蚁、美洲原颚蚁和弯刺切胸蚁的种群序列数据
- 种群遗传数据文件:
- T.lonforGenepop.txt、T.curforGenepop.txt、P.ameforGenepop.txt: TXT格式的Genepop输入文件,包含三种蚂蚁的微卫星基因分型数据
- P.am_tandem.csv、T.lon_tandem.csv、T.cur_tandem.csv: CSV格式文件,记录种群数量、位点数量等基本信息及微卫星分型数据
- P.ameGeogDistances.csv: CSV格式文件,存储美洲原颚蚁不同种群间的地理距离数据
- R语言脚本文件:
- RSamplingLocations.r、RScript_MtDNA_JostD_and_Gst_Permutation.pdf、RscriptMicroSatsWithPermutation.r、RPairw_D_Gst_MtDna_Penningsjeb2011.r、RAllPops_D_Gst_MtDNA_PenningsJEB2011.r: R脚本文件及PDF说明文档,用于计算Jost D、Gst等遗传分化指数及置换检验
适用场景
- 进化生物学研究: 分析寄生-宿主系统的遗传多样性与种群结构特征
- 协同进化机制研究: 探究寄生蚂蚁与宿主间协同进化的选择压力及扩散模式
- 种群遗传学方法验证: 比较Jost D、Gst等不同遗传分化指数的适用性
- 性别特异性扩散分析: 研究蚂蚁种群中雌雄个体的扩散能力差异及物种间的异同