数据集概述
本数据集为论文《Temperature and Biodiversity Regulate the Robustness of Plant-Microbe Networks in Natural Forests at Large Scale》的配套数据与代码，包含植物-微生物网络属性、分类信息、原始输入数据、网络结果文件及分析代码，支持相关研究的复现与扩展。
文件详解
- 网络属性与分类文件：
- 26_local_IDEN_property_summary_all.txt：26个植物-微生物网络的属性汇总文件（如连通性、嵌套性、稳健性等）
- Bacteria_uparse_Classifier_of_16srrna.txt：微生物OTU分类信息文件
- plant_for_network_ncbi_taxnonomy.txt：植物物种分类信息文件
- 原始输入数据（RawInputs目录）：
- BDGS_Filtered_matrix_with_majority.txt：BDGS样地的植物与微生物群落矩阵示例文件
- 网络结果文件（Results目录）：
- BDGS_SpiecEasi_bipartite_cytoscape.sif：BDGS样地植物-微生物网络结构文件（Cytoscape格式）
- BDGS_SpiecEasi_bipartite_cytoscape_node_FG.txt：BDGS样地植物-微生物网络节点属性文件
- 分析代码文件：
- Plots_bipartite_networks.R：论文图1（植物-微生物网络可视化）的绘图代码
- Plots_correlations.R：论文图2、3（相关性分析）的绘图代码
- Plots_PLS-PM.R：论文图4（PLS-PM分析）的绘图代码
适用场景
- 森林生态学研究：分析温度、生物多样性对植物-微生物网络稳健性的调控机制
- 微生物生态学研究：探究自然森林中植物与微生物的互作网络结构特征
- 生物信息学分析：复现或扩展基于iNAP平台的植物-微生物网络构建流程
- 生态数据可视化：学习使用R语言绘制植物-微生物网络及相关性分析图表
