数据集概述
本数据集包含组蛋白修饰位点相关的通路模型、子网络及信号通路，涉及细胞生物学与癌症领域的分子机制。模型通过Pathway Studio软件手动重建，基于文献提取的分子相互作用网络及公共数据库信息，提供丰富的实体注释与相互作用参考。
文件详解
该数据集包含多个目录和文件，具体说明如下：
- 模型文件（位于Files with pathways/Files with models/目录下）：
- Selection in Histone Modification.zip：组蛋白修饰相关模型压缩包
- Selection in Hallmarks of Cancer (14)_ Epigenetics.zip：癌症特征表观遗传学模型压缩包
- 元数据文件（位于Files with pathways/Metadata/目录下）：
- 通路富集分析实体元数据（Entities Metadata of Pathways for Enrichment Analysis/）：包含多个CSV文件，如Selection in Interplay between SOX1.csv、Selection in USP28 Mediated Epigenetic and N.csv等，字段包括Name（名称）、Description（描述）、Object Type（对象类型）、Cell Localization（细胞定位）等
- 子网络富集分析实体元数据（Entities Metadata of Sub-Networks for Enrichment Analysis/）：包含多个CSV文件，如Selection in RPS6KA5 Modifies Histone 3.csv、Selection in H2A Modification Sites.csv等
- Relation Metadata for "Interplay between SOX11, CCND1 and EZH2 in MCL".xlsx：特定通路的关系元数据Excel文件
- DESCRIPTIONS for Cancer Epigenetics pathways.docx：癌症表观遗传学通路描述文档
- 图片文件（位于Files with pathways/Images/目录下）：
- 癌症表观遗传学通路图片（Cancer Epigenetics Pathways (manually reconstructed)/）：如USP16 Mediated Epigenetic and Non-Epigenetic Effects.png、H2AK119 Deubiquitination.png等PNG格式图片
- 组蛋白修饰子网络图片（Protein Modifications (Histones) Sub-Networks/）：如H3 Lysine Modification Sites.png、H2A Modification Sites.png等PNG格式图片
- 链接文件：
- LINKS for Protein Modifications (Histones) Sub-Networks.pdf：组蛋白修饰子网络链接文档
- LINKS for Hallmarks of Cancer (14) Cancer Epigenetics Pathways.pdf：癌症特征表观遗传学通路链接文档
适用场景
- 表观遗传学研究：分析组蛋白修饰位点在细胞生物学中的作用机制
- 癌症研究：探究组蛋白修饰相关通路与癌症发生发展的关联
- 分子相互作用网络分析：基于模型数据构建和验证组蛋白修饰相关的分子网络
- 富集分析：利用元数据文件开展通路富集分析，识别关键生物学过程
- 教学与科普：通过图片和模型直观展示组蛋白修饰的分子机制
