找到171个数据集

分类: 公开数据 标签: 结构生物学

过滤结果
  • Integrative_Structure_PTBP1_EMCV_IRES复合物溶液结构测定数据

    2026年1月8日 30 118 41

    数据集概述 本数据集包含RNA结合蛋白PTBP1与脑心肌炎病毒(EMCV)RNA内部核糖体进入位点(IRES)复合物的溶液整合结构模型及支撑数据,涵盖多组约束条件下的集合结构、DEER-EPR原始数据、SANS/SAXS曲线、约束文件及图表源数据,共27个文件,用于生物分子复合物结构研究。 文件详解 集合结构文件...
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  • ESRF_4XYD_Roseobacter_denitrificans硝酸还原酶晶体衍射图像数据

    2026年1月8日 30 147 119

    数据集概述 本数据集包含玫瑰杆菌(Roseobacter denitrificans)硝酸还原酶(NOR)晶体的X射线衍射图像,是PDB条目4XYD结构解析的原始数据来源。数据由ESRF收集,支持蛋白质三维结构研究,仅包含一个压缩文件。 文件详解 文件名称:RdNOR_diffraction_images_4xyd.zip 文件格式:ZIP...
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  • ProtNAff_Based_Protein_bound_Nucleic_Acid过滤与片段库数据

    2026年1月6日 30 30 6

    数据集概述 本数据集包含由ProtNAff工具生成的蛋白质结合核酸过滤与片段库,用于相关论文研究。数据以numpy格式矩阵存储,包含简化原子和全原子片段文件,总计3个文件,涵盖JSON和TGZ两种格式。 文件详解 文件名称:fragments_clust.json 文件格式:JSON 字段映射介绍:未提供具体字段映射信息...
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  • XChem_Based_SARS_CoV_2主蛋白酶与PCM_0103067复合物原始衍射数据_存档

    2026年1月5日 0 93 47

    数据集概述 本数据集为SARS-CoV-2主蛋白酶与PCM-0103067复合物的原始衍射数据,对应PDB ID 5RFJ,是Diamond Light Source的i04-1光束线上开展的XChem晶体学片段筛选项目的一部分。原始数据可支持相关方对该复合物结构进行重新分析,补充已自动处理的沉积结构数据。 文件详解...
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  • Melittin_Recombinant_Based同位素标记蜂毒肽重组表达与化学酰胺化研究数据_SI

    2026年1月2日 30 133 81

    数据集概述 本数据集为蜂毒肽(Melittin)相关研究的补充数据,包含7个补充表格和25个PDB结构文件,记录了阳离子膜裂解肽列表、蜂毒肽骨架化学位移、15N-1H耦合参数、AlphaFold模型与RDC数据的拟合分析结果,以及实验涉及的蛋白质原子坐标,支撑同位素标记蜂毒肽的重组表达与化学酰胺化研究。 文件详解 表格文件(Excel格式)...
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  • mpro_x1132_PDB5RF9_SARS_CoV_2主蛋白酶Z217038356复合物原始衍射数据

    2026年1月1日 30 123 116

    数据集概述 本数据集为SARS-CoV-2主蛋白酶与化合物Z217038356形成复合物的原始衍射数据,对应ID mpro-x1132及PDB ID 5RF9。数据由Diamond Light Source的i04-1光束线通过XChem晶体片段筛选实验采集,原始数据可供重新分析使用。 文件详解 文件名称:mpro-x1132.zip 文件格式:ZIP...
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  • mpro_x1093_Based_SARS_CoV_2主蛋白酶与Z1400780201复合物衍射原始数据

    2026年1月1日 30 114 73

    数据集概述 本数据集为SARS-CoV-2主蛋白酶与化合物Z1400780201复合物的原始衍射数据,对应ID mpro-x1093及PDB ID 5RF7。数据由Diamond Light Source的i04-1光束线采集,属于XChem晶体学片段筛选项目,提供原始数据供重新分析使用。 文件详解 文件名称:mpro-x1093.zip...
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  • 基于AlphaFold2的SARS_CoV_2奥密克戎刺突蛋白与ACE2受体构象及结合机制分析结果_压缩文件

    2025年12月29日 30 91 81

    数据集概述 本数据集围绕SARS-CoV-2刺突蛋白Omicron变体与ACE2受体的复合物展开,通过AlphaFold2构建的结构集合及分子动力学模拟,探索其构象景观与结合机制,为病毒-受体相互作用的研究提供支撑。 文件详解 压缩文件 文件名称:SpikeProteinsResultsUpdated.zip 文件格式:ZIP...
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  • protein_protein_complex_affinity_prediction_跨界面电荷水平数据集

    2025年12月29日 30 146 100

    数据集概述 本数据集核心内容为跨不同界面电荷水平的蛋白质-蛋白质复合物亲和力预测相关数据,包含一个压缩文件,未进行训练/测试、数据/标签或原始/处理数据的分割,主要用于生物信息学领域的蛋白质相互作用研究。 文件详解 文件名称:PDBbind_subset.zip 文件格式:ZIP...
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  • SARS_CoV_2_基于_B_1_1_529_变异株的刺突蛋白受体结合域结构及中和抗体相互作用预测数据_1_0_0

    2025年12月27日 30 55 31

    数据集概述 本数据集包含使用AlphaFold2和HADDOCK工具预测的SARS-CoV-2 B.1.1.529变体刺突蛋白受体结合域(RBD)结构,以及该结构与中和抗体的结合相互作用预测结果。数据旨在揭示B.1.1.529变体RBD的潜在结构变化,及其对疫苗有效性的影响。数据集仅包含一个压缩文件。 文件详解 文件名称:SARS-...
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  • USP5_Zf_UBD类似物SPR实验选择性测试数据集

    2025年12月23日 30 91 57

    数据集概述 该数据集记录了通过表面等离子体共振(SPR)实验,测定商用化合物类似物与USP5的锌指泛素结合域(Zf-UBD)的结合亲和力,并测试其对HDAC6 Zf-UBD选择性的数据及相关文件。 文件详解 该数据集包含3个文件,具体说明如下: - 20190508spr.pptx:PPT格式文件,可能包含SPR实验的流程、结果展示或报告内容 -...
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  • 大鼠Arc蛋白与RNA相互作用及核酸伴侣功能研究数据集

    2025年12月13日 30 63 25

    数据集概述 本数据集包含支持大鼠Arc蛋白与RNA相互作用及核酸伴侣(NAC)活性研究的原始和处理数据,通过微量热泳动(MST)、NAC活性测定、RNA三维结构建模及蛋白-RNA复合物对接等方法获取,为相关分子机制研究提供数据支持。 文件详解 文件名称:...
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  • 核质掩码数据集_莱茵衣藻冷冻电子断层扫描

    2025年12月23日 30 110 79

    数据集概述 该数据集包含用于莱茵衣藻冷冻电子断层扫描研究的核质掩码文件,核心为一百二十六张MRC格式的二进制掩码,用于核小体颗粒的定向模板匹配,相关研究成果对应EMD-19906。 文件详解 文件名称: nuclear_masks.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明: 压缩包内包含一个文件夹,文件夹中有126个MRC格式(mode...
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  • Mlynsky等人JCTCRNA力场研究原始数据集2025

    2025年12月22日 30 41 20

    数据集概述 该数据集为Mlynsky等人2025年发表于《Journal of Chemical Theory and Computation》的RNA力场研究论文配套原始数据,包含论文原文、补充信息及相关数据集,为RNA力场模拟研究提供数据支撑。 文件详解 Mlynsky-et-al_JCTC2025.pdf:PDF格式,研究论文原文...
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  • SARS_CoV_2主蛋白酶与PCM_0102281复合物结构原始衍射数据集

    2025年12月19日 30 42 8

    数据集概述 本数据集包含SARS-CoV-2主蛋白酶与化合物PCM-0102281形成复合物的原始X射线衍射数据,该数据源自Diamond Light Source的XChem结晶片段筛选实验,对应PDB编号5RES,为结构生物学研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称: mpro-x0769.zip 文件格式: ZIP压缩包(.zip) 内容说明:...
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  • PPM1H磷酸酶对Rab_GTPases特异性的结构基础Figure5原始数据集

    2025年12月25日 30 125 80

    数据集概述 本数据集为论文《PPM1H磷酸酶对Rab GTPases特异性的结构基础》中Figure5的原始支撑数据,包含图表数值数据、蛋白质凝胶图像及蛋白质印迹图像等实验原始材料,为验证PPM1H与Rab蛋白相互作用的研究结论提供数据支持。 文件详解 数值数据文件: Figure 5BE...
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  • O_Buß与S_Jager补充数据集_β_酮酯酶水解HTS测定的统计评估

    2025年12月25日 30 57 23

    数据集概述 本数据集是O.Buß与S.Jager关于β-酮酯酶水解高通量筛选(HTS)测定统计评估研究的补充数据,包含计算用PDB结构文件、统计分析R脚本、活性测定校准数据及实验用酶的SDS-PAGE凝胶图片,为相关研究提供原始数据支持。 文件详解 该数据集包含5个文件,具体说明如下: - 统计分析R脚本压缩包: - 文件名称:...
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  • 双连续微乳液中α_突触核蛋白与细菌视紫红质的圆二色谱及小角中子散射分析数据集

    2025年12月25日 30 147 69

    数据集概述 本数据集记录了α-突触核蛋白(ASYN)和细菌视紫红质(BR)两种膜蛋白在双连续微乳液(BMEs)中的结构分析数据,涵盖圆二色谱(CD)表征的二级结构变化及小角中子散射(SANS)捕获的相互作用与聚集行为,为膜蛋白研究提供实验数据支持。 文件详解 文件名称: readme_file_for_data.pdf,文件格式: PDF,内容:...
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  • 膜有序性检测的机械敏感分子探针扭转与倾斜数据集

    2025年12月24日 30 164 143

    数据集概述 本数据集包含支持论文补充图表S11和S12的原始数据与实验流程,聚焦机械敏感分子探针的扭转、倾斜特性与膜有序性的关系,采用Origin格式存储实验数据及PDF文档。 文件详解 核心数据文件(.opj格式,共6个): cold_DOPC.OPJ:低温DOPC膜条件下的分子探针实验数据...
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  • HIF_2a和ARNT在有无TACC3存在下的氢氘交换数据集

    2025年12月24日 30 22 12

    数据集概述 该数据集包含HIF-2a和ARNT在有无TACC3存在条件下的氢氘交换实验数据,通过单个压缩文件存储相关实验结果。 文件详解 文件名称: HIF2_uptake_plots.zip 文件格式: ZIP压缩包(.zip) 内容说明: 压缩包内包含与HIF-2a和ARNT氢氘交换实验相关的吸收曲线图数据,具体字段及结构需解压后查看原始文件。...
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