数据集概述
本数据集包含RNA结合蛋白PTBP1与脑心肌炎病毒（EMCV）RNA内部核糖体进入位点（IRES）复合物的溶液整合结构模型及支撑数据，涵盖多组约束条件下的集合结构、DEER-EPR原始数据、SANS/SAXS曲线、约束文件及图表源数据，共27个文件，用于生物分子复合物结构研究。
文件详解
- 集合结构文件
- 文件名称：PTBP1_EMCV_IRES_main_ensemble.zip、PTBP1_EMCV_IRES_validation_ensemble.zip等（共12个.zip文件）
- 文件格式：ZIP（内含PDB文件及集合规范文件）
- 字段映射介绍：包含所有构象体的PDB文件，记录构象体的原子坐标；集合规范文件报告各构象体的种群占比
- 实验原始数据文件
- 文件名称：Deer_primary_and_distributions.zip、SANS_SAXS_data.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：Deer_primary_and_distributions.zip含35个自旋标记对的DEER-EPR原始数据及位点间距离分布数据；SANS_SAXS_data.zip含不同探测器距离的小角中子散射（SANS）曲线、小角X射线散射（SAXS）曲线及对应分辨率文件
- 约束文件
- 文件名称：PTBP1_EMCV_IRES_ensemble_fit_restraints.mcx
- 文件格式：.mcx
- 字段映射介绍：用于MMMx软件集合拟合的约束文件，指定距离分布的平均距离、标准差及CYANA生成原始集合时的上下距离边界
- 图表源数据文件
- 文件名称：Figure_S9.csv、Figure_S6.csv、Table_S2.csv、Table_S1.xlsx等（共13个.csv、1个.xlsx文件）
- 文件格式：.csv、.xlsx
- 字段映射介绍：包含图表对应的数值数据，如Figure_S9.csv含原始集合大小、距离分布平均重叠度、SAS卡方均值等统计数据；Figure_S6.csv含SAXS拟合的q值、实验值、误差、拟合值等散射数据；表格文件含实验结果的结构化统计数据
数据来源
论文“Integrative structure determination of PTBP1-viral IRES complex in solution”
适用场景
- 生物分子复合物结构分析: 利用集合结构模型研究PTBP1与EMCV IRES复合物的溶液构象多样性及种群分布
- 结构生物学约束条件验证: 通过不同约束（全约束、仅DEER约束）下的集合结构，验证约束条件对结构模型的影响
- 生物物理实验数据整合: 结合DEER-EPR、SANS、SAXS数据，探究生物分子复合物的结构-功能关系
- 结构建模方法优化: 分析NNLLSQ方法拟合种群的效果，优化生物分子集合结构的建模策略
- 学术图表数据复用: 利用图表源数据复现论文中的统计结果，支持相关领域的二次分析与验证
