找到254个数据集

标签: 结构生物学

过滤结果
  • LDDT_Based所有诱饵结构LDDT分数数据

    2026年2月9日 30 137 60

    数据集概述 本数据集包含所有诱饵结构的LDDT分数数据,LDDT(Local Distance Difference Test)是用于评估蛋白质结构预测准确性的指标。数据集以压缩文件形式提供,无额外目录结构,可直接用于生物信息学相关分析。 文件详解 文件名称:LDDT.zip 文件格式:ZIP...
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  • Control_Based_生物医学结构数据

    2026年2月1日 30 159 143

    数据集概述 本数据集为Control数据集,包含三十个文件,无目录结构。文件类型涵盖.mrc、.pdb和.xml,其中.mrc文件占比约六十六点六七%,主要涉及模型相关语义关键词,可用于生物医学领域的结构分析。 文件详解 .mrc文件(20个)...
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  • CH_pi_蛋白质_碳水化合物结合位点定向灵活性数据

    2026年1月31日 30 138 55

    数据集概述 本数据集与论文“CH-pi Interactions Confer Orientational Flexibility in Protein-Carbohydrate Binding Sites”相关,包含支持该研究的数据及模型。数据聚焦CH-pi相互作用对蛋白质-碳水化合物结合位点取向灵活性的影响,为分子相互作用机制研究提供基础资料。...
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  • PPM1H_Rab_GTPases_结构特异性研究原始数据

    2026年1月30日 30 72 41

    数据集概述 本数据集为论文《Structural basis for the specificity of PPM1H phosphatase for Rab GTPases》的图2原始数据,包含PPM1H D288A与磷酸化Rab8A的交联实验结果、交联距离列表及酶活性测定数值数据,共3个文件,支持研究PPM1H磷酸酶对Rab...
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  • FFA2_Simulation_Based_丙酸结合受体模拟数据

    2026年1月28日 30 178 8

    数据集概述 本数据集为论文“Structural insights into lipid chain-length selectivity and allosteric regulation of FFA2”配套的丙酸结合FFA2受体模拟数据,包含1个压缩文件,无目录结构,可用于研究FFA2受体的脂质链长选择性及变构调节的结构机制。 文件详解...
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  • in_meso_Based_跨膜α_螺旋肽晶体生长脂质微环境研究数据

    2026年1月26日 30 55 40

    数据集概述 本数据集聚焦于跨膜α-螺旋肽晶体生长过程中的脂质中间相微环境研究,通过同步辐射小角X射线散射技术,验证了in meso结晶机制的实验证据,包括类晶立方相作为晶体生长起点、局部层状相的存在等关键发现,为该结晶机制提供数据支持。 文件详解 文件名称:Database.zip 文件格式:ZIP(压缩包) 字段映射介绍:压缩包内包含与跨膜α-...
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  • PDB_2xtt_Based_PDB结构2xtt成对ADP距离过滤数据

    2026年1月22日 30 31 14

    数据集概述 本数据集包含PDB结构2xtt中低于阈值的成对ADP距离信息,涵盖欧氏距离、黎曼距离等8种距离计算方式,并过滤掉黎曼距离高于0.8的记录,为蛋白质结构分析提供结构化的距离数据支持。 文件详解 文件名称:distances_totalall_2xtt_filtered.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • ACVR1蛋白纯化及与LDN_193189等化合物共结晶实验数据_2018

    2026年1月21日 30 176 142

    数据集概述 本数据集记录了组成型活性ACVR1蛋白的纯化过程,以及其与LDN-193189和另外三种化合物进行共结晶的相关实验信息,为蛋白质结构研究提供基础实验数据支撑。 文件详解 文件名称:Purification of ACVR1 for co_crystallisation with LDN_193189 31_01_2018_1.docx...
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  • ScNPC_Modeling_2020_酵母核孔复合体细胞内结构整合建模数据

    2026年1月20日 30 179 44

    数据集概述 本数据集包含用于酵母核孔复合体(ScNPC)细胞内结构整合建模的源代码文件、输入文件及输出整合模型。数据支撑《Nature》2020年发表的相关研究,可用于分析ScNPC的细胞内结构特征及周转过程,共包含11个文件。 文件详解 文档类文件 文件名称:README.md 文件格式:MD...
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  • EMPIAR_12612_Source_菠菜类囊体光系统II颗粒分布分析数据

    2026年1月20日 30 41 10

    数据集概述 本数据集包含用于分析菠菜类囊体中光系统II(Photosystem II)颗粒分布的位置数据,对应论文“Molecular architecture of thylakoid membranes within intact spinach...
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  • EMPIAR_11830_Based_莱茵衣藻原位冷冻电镜断层扫描注释数据集

    2026年1月20日 30 75 32

    数据集概述 本数据集为EMPIAR-11830的注释数据,对应莱茵衣藻的原位冷冻电镜断层扫描研究。数据集包含1个文件,以表格形式存储相关注释信息,为结构生物学领域研究莱茵衣藻的亚细胞结构提供标注支持。 文件详解 文件名称:Chlamy_Tomo_Annotations_v2.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • MD_mAMCase_GlcNAc6复合物pH条件分子动力学模拟数据2023

    2026年1月20日 30 173 36

    数据集概述 本数据集包含Díaz et al.(2023)手稿中Figure 5涉及的小鼠AMCase(mAMCase)与GlcNAc6复合物在pH 2.0和pH 6.5条件下的10 ns分子动力学模拟分析所需全部文件,支持模拟结果的复现与深入分析。 文件详解 Figures目录 包含Asp138 X1角分布PDF文件、Asp138...
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  • GkaP_Active_site_loop_酶活性位点构象与底物特异性调控数据

    2026年1月20日 30 178 71

    数据集概述 本数据集围绕Geobacillus kaustophilus HTA426来源的磷酸三酯酶样内酯酶(GkaP)展开,通过定点突变和X射线晶体学分析,探究活性位点环构象对酶混杂活性的调控机制,特别是Y99L突变体对底物特异性的反转效应及结构基础。数据集包含2个文件,支持酶催化机制与分子进化研究。 文件详解 结构数据文件...
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  • Zenodo_Based_K58N_α_突触核蛋白纤维冷冻电镜分析关键资源数据

    2026年1月19日 30 98 42

    数据集概述 本数据集为Zenodo平台发布的冷冻电镜分析配套资源,对应论文“A Novel Alpha-Synuclein K58N Missense Variant in a Patient with Parkinson’s Disease”。包含关键资源表、原纤维分布数据、分辨率验证文件及可视化脚本,支持K58N型α-...
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  • Rubicon_Pacer_RH结构域pRAB7A结合特异性研究数据FINAL

    2026年1月19日 30 161 50

    数据集概述 本数据集包含研究Rubicon和Pacer的RH结构域与pRAB7A结合特异性的相关实验数据,涵盖原始图像、结构文件、序列文件、实验数据表格及压缩图像包等9个文件,用于支持蛋白质相互作用的分析与验证。 文件详解 原始图像文件(.tif格式,共5个) 文件名称:Rubicon_phos_raw...
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  • SNAPc_complex_人类SNAPc复合物低温电镜密度与高斯混合模型数据

    2026年1月19日 30 198 103

    数据集概述 本数据集包含用于人类SNAPc复合物整合建模的分段低温电镜(cryoEM)密度图和衍生高斯混合模型,涉及snRNA启动子RNA聚合酶II和III招募机制的结构研究,共10个文件。 文件详解 压缩包文件 文件名称:SNAPCfiles.zip 文件格式:ZIP 字段映射介绍:整合的SNAPc复合物相关文件压缩包...
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  • doubleHelix_Based_核酸序列识别验证工具案例研究数据_archive

    2026年1月18日 30 89 49

    数据集概述 本数据集为论文《doubleHelix: nucleic acid sequence identification, assignment and validation tool for cryo-EM and crystal structure...
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  • TMEM55B_Interactor_MS_Based溶酶体平台互作蛋白组学研究数据

    2026年1月18日 30 20 3

    数据集概述 本数据集为基于DIA质谱技术的蛋白质互作分析数据,围绕TMEM55B与RILPL1结合机制展开,包含两组对比实验的搜索结果及完整的LC和DIA-MS参数,用于揭示溶酶体适配器组装的保守TBM基序作用,共3个文件。 文件详解 Table1.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Huntingtin_Open_Lab_Notebook_亨廷顿蛋白负染网格制备数据

    2026年1月18日 30 165 0

    数据集概述 本数据集属于亨廷顿蛋白结构功能开放实验室笔记项目,核心内容为亨廷顿蛋白负染网格制备相关数据,仅包含一个文件,无目录层级划分,未进行训练/测试、数据/标签或原始/处理数据的拆分。 文件详解 文件名称:Negative Stain Grids.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • AlphaFold3_Based_kinesin_2β_发夹基序运动性调控模型数据_2025

    2026年1月17日 30 157 88

    数据集概述 本数据集包含由AlphaFold3生成的kinesin-2相关蛋白质复合物的结构模型文件,对应论文主题为β-发夹基序对kinesin-2运动性的调控。数据涵盖三种蛋白质组合的模型与数据文件,共6个文件,用于支持分子结构与功能关系的研究。 文件详解 Kif3A-Kif3B相关文件...
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