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分类: 公开数据 标签: ASV表

过滤结果
  • Mycobiome_ASV_Based_年度植物竞争实验结果及真菌群落关联数据

    2026年1月19日 0 156 70

    数据集概述 本数据集包含八项一年生草本植物竞争实验结果及关联真菌群落ASV(扩增子序列变体)表数据,旨在验证植物物种相关真菌群落差异对种间竞争动态的影响,探究真菌群落分歧在介导植物竞争中的作用,共含10个文件。 文件详解 文档类文件 README.md(MD格式):数据集说明文档,含实验背景、数据用途及DOI链接 表格类文件...
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  • Aglieri_Based_地中海港口鱼类eDNA检测与非本地物种传播数据集2023

    2026年1月18日 30 9 3

    数据集概述 本数据集为地中海港口鱼类环境DNA(eDNA)宏条形码检测数据,2018年和2019年在多个地中海港口采集表层水样(2018年为2升单重复,2019年为1升四重复),通过12S rRNA和线粒体COI基因标记生成数据。包含各采样周期及标记对应的生物信息学分析后ASV/MOTUs表、 curated注释表,以及OTU存在-缺失表,共一个文件。...
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  • URT_微生物组_家畜暴露_基于荷兰山羊养殖户与农村居民鼻咽和口咽微生物组的过滤数据

    2026年1月18日 30 155 75

    数据集概述 本数据集包含荷兰山羊养殖户与农村居民的鼻咽(NP)和口咽(OP)微生物组数据,以phyloseq S4对象形式提供,包含扩增子序列变体(ASV)表、分类学表和样本元数据。数据经DADA2 pipeline处理及去污染、低质量样本过滤,最终保留904个NP样本和1046个OP样本,支持微生物组关联分析。 文件详解...
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  • phyloseq_Object_Source_鸡泄殖腔微生物群16S宏分类学时间动态数据

    2026年1月13日 30 108 80

    数据集概述 本数据集包含一个可直接加载的phyloseq R S4对象,以及配套的元数据表格,用于研究成年蛋鸡泄殖腔微生物群的时间动态变化。数据基于16S rRNA基因扩增子测序,通过DaDa2和phyloseq R包构建,涵盖室内和户外养殖条件下鸡群微生物群的纵向监测信息。 文件详解...
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  • Phyloseq_Based_牛初乳储存方法对细菌计数及微生物组成影响研究数据_ReadyToLoad

    2026年1月2日 30 132 130

    数据集概述 本数据集为可直接加载的phyloseq R S4对象,包含牛初乳样本的ASV表、分类表及样本元数据(基于16S V3-V4区域测序)。数据通过DaDa2和phyloseq R包构建,原始测序数据存储于NCBI-SRA的BioProject PRJNA872909,用于研究不同储存方法对牛初乳总细菌计数及微生物组成的影响。 文件详解...
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  • 玉米微生物依赖杂种优势研究数据集

    2025年12月23日 30 166 80

    数据集概述 本数据集包含与《玉米微生物依赖杂种优势》研究相关的实验数据与统计代码,涵盖土壤熏蒸实验的16S和ITS扩增子数据、田间实验原始数据及合成群落定殖率测量数据,为该研究提供完整的数据支持。 文件详解 文件名称: _MDH_Zenodo_final.zip(压缩包) 文件格式: ZIP (.zip) 包含内容:...
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  • 冰川补给溪流细菌微生物组多样性与生物地理学数据集

    2025年12月22日 30 43 38

    数据集概述 该数据集包含冰川补给溪流细菌微生物组多样性与生物地理学研究的相关数据,涵盖研究主图与扩展数据图关联的数据表、16S PCR扩增凝胶图片及处理后的数据(如ASV表、分类表、元数据和系统发育树),为相关研究提供支持。 文件详解 文件名称:NOMIS 16S gels.pdf 文件格式:PDF 内容:包含16S...
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  • JEDI_Paper_Based_微生物研究ASV表与流程完整数据集

    2025年12月20日 30 133 107

    数据集概述 本数据集为JEDI论文配套数据,包含多组应用示例的ASV表、改进版nf-core/ampliseq流程文件及SSU rRNA基因特定可变区的 curated参考数据库,覆盖V3V5和V4V9区域,支持微生物群落分析研究。 文件详解 该数据集包含三类核心文件,具体说明如下: - ASV表文件: - AE1-ROSCOFF_ALGAE相关: -...
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  • 宿主水平生物多样性对珊瑚礁微生物组动态与网络影响数据集

    2025年12月19日 30 128 21

    数据集概述 本数据集包含与"宿主水平生物多样性塑造珊瑚礁微生物组动态与网络"相关的研究数据,涵盖珊瑚礁微生物组的ASV表、元数据、分类学注释、多样性指数及KEGG通路映射等文件,用于支持相关研究论文的图表生成。 文件详解 raw_host-associated_1.asvs.tsv:TSV格式,宿主关联样本的ASV表 raw_host-...
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  • 意大利卡梅罗塔海岸环境DNA宏条形码公民科学采样数据集

    2025年12月11日 30 93 73

    数据集概述 本数据集包含意大利卡梅罗塔海岸基于公民科学采样的环境DNA(eDNA)宏条形码分析结果,涵盖采样计划、功能群定义、相对丰度、营养关系等补充信息,以及18S-V4和COI标记的扩增子序列变异(ASV)表和不同生境的生物多样性可视化Krona图,为海岸生物多样性监测提供数据支持。 文件详解 该数据集包含以下文件: - 补充材料文件: -...
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