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SARS_CoV_2全基因组结构与功能建模数据集
数据集概述 本数据集提供了针对SARS-CoV-2基因组中所有蛋白质的同源模型及功能注释信息,涵盖蛋白质结构模型、序列数据和多序列比对文件,为研究新冠病毒蛋白质的结构特征与功能机制提供数据支持。 文件详解 文件名称: models (1).zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明: 包含SARS-CoV-2蛋白质的同源模型数据 文件名称: seq...
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水蚤进化全基因组系统发育重建补充材料数据集
数据集概述 该数据集为Van Damme等人研究论文的补充材料,包含经同行评审的补充图表、表格、方法、讨论及参考文献,聚焦水蚤进化的全基因组系统发育重建研究,为理解枝角类进化提供额外分析框架与证据支持。 文件详解 文件名称:...
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稀疏建模交互作用的全基因组上位性检测补充数据集
数据集概述 本数据集为生物银行规模研究中,基于稀疏建模交互作用进行全基因组上位性快速检测的补充结果与来源文件,包含相关研究的附加支持数据。 文件详解 文件名称: jdstamp/sme-supplementary-v0.0.2.zip 文件格式: ZIP (.zip) 内容说明:...
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中国猪群2009年H1N1大流行源内部基因多样性扩展与建立数据集
数据集概述 本数据集记录2009-2012年中国猪流感病毒(SIVs)监测研究结果,包含387株SIVs全基因组进化分析数据,揭示17种含2009 H1N1大流行源基因的重组基因型,重点呈现其内部基因在猪群中的建立及主导地位变化。 文件详解 文件名称: Sup fig and table.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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黑腹果蝇全基因组连锁不平衡独立SNP估算数据集_Sussex_LHM
数据集概述 该数据集围绕黑腹果蝇(Sussex LHM品系)的全基因组分析展开,通过R计算染色体臂SNP密度,利用Plink 1.9筛选连锁不平衡独立SNP,输出独立SNP ID列表,为遗传学研究提供基础数据。 文件详解...
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陆生等足类Cubaris_murina线粒体基因组碱基组成数据表
数据集概述 本数据集为陆生等足类Cubaris murina线粒体基因组的碱基组成数据表,包含全基因组及13个基因(含蛋白编码基因、非编码区)的核苷酸组成、AT含量、AT偏斜与GC偏斜等核心指标,为研究该物种线粒体基因组特征提供基础数据。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML(.html) 字段映射:...
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中国春小麦端粒到端粒全基因组数据集CS_IAAS_v1_1
数据集概述 本数据集提供了六倍体小麦品种中国春的端粒到端粒(T2T)无间隙参考基因组CS-IAAS_v1.1,包含145.1亿碱基对,覆盖21个着丝粒和42个端粒,为研究小麦基因组演化、转录组及蛋白质组提供基础数据。 文件详解 基因组序列文件: CS-IAAS_v1.1.zip:压缩格式,包含中国春小麦全基因组序列数据 基因注释文件: CS-...
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东亚人群严格变异_基因顺式蛋白数量性状位点蛋白质组_表型组全基因组孟德尔随机化图谱
数据集概述 该数据集为东亚(京都-长滨)队列的蛋白质组-表型组全基因组孟德尔随机化图谱,包含通过严格变异-基因标准定义的顺式蛋白数量性状位点(cis-pQTLs)数据,为相关医学研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称:all_strict_v2g_cis_EAS-Kyoto.zip 文件格式:ZIP压缩包(.zip)...
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中国蛛蟋亚科Rhaphidophora_quadrispina线粒体基因组核苷酸组成与偏斜表数据集
数据集概述 本数据集为学术论文中的表格数据,核心内容是Rhaphidophora quadrispina线粒体基因组的核苷酸组成及偏斜分析结果,包含全基因组、蛋白编码基因(分密码子位置)、转运RNA、核糖体RNA及控制区的碱基占比与AT/GC偏斜值。 文件详解 文件名称:table.html 文件格式:HTML(.html)...
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肺炎支原体全基因组多位点序列分型方案数据集
数据集概述 本数据集包含肺炎支原体全基因组多位点序列分型(wgMLST)方案构建所需的数据,涉及基因组组装文件及最终的wgMLST分型方案,为肺炎支原体的基因分型研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称:NCBI_assemblies.zip 文件格式:ZIP压缩包 内容:包含用于构建分型方案的RefSeq登录号列表及基因组组装FASTA文件...
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Topsicle端粒长度估计方法程序包
数据集概述 本数据集为论文《Topsicle: a method for estimating telomere length from whole genome long-read sequencing data》提供配套程序包,包含论文所用的Topsicle方法程序版本,用于从全基因组长读长测序数据中估计端粒长度。 文件详解 文件名称:...
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莺总科内十个鸣禽科全基因组分析数据集
数据集概述 该数据集基于莺总科(Sylvioidea)内十个不同科鸣禽的全基因组数据(含两篇已发表和八篇新测序基因组),旨在分析其性染色体系统多样性。核心发现包括苇莺科(以水蒲苇莺为代表)存在涉及4号染色体部分区域的新型融合,同时确认了所有十个科均存在Z染色体与4A号染色体部分区域的融合,并排除了3号和5号染色体部分区域融合在特定科外的存在。 文件详解...
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布氏锥虫全基因组亚细胞蛋白定位数据集TrypTag
数据集概述 本数据集是TrypTag全基因组蛋白定位项目的数据,包含布氏锥虫(单细胞真核病原体)蛋白亚细胞定位的宽场荧光显微镜图像相关信息。数据集未包含显微图像,而是提供定位摘要、脚本、代码、引物序列及基因ID与图像数据存储DOI的索引。 文件详解 文件名称: readme.docx,文件格式: DOCX,内容:...



