中国春小麦端粒到端粒全基因组数据集CS_IAAS_v1_1

数据集概述

本数据集提供了六倍体小麦品种中国春的端粒到端粒（T2T）无间隙参考基因组CS-IAAS_v1.1，包含145.1亿碱基对，覆盖21个着丝粒和42个端粒，为研究小麦基因组演化、转录组及蛋白质组提供基础数据。

文件详解

• 基因组序列文件：
• CS-IAAS_v1.1.zip：压缩格式，包含中国春小麦全基因组序列数据
• 基因注释文件：
• CS-IAAS_v1.1_annotation.zip：压缩格式，含高置信度与低置信度基因的结构注释（GFF格式）
• CS-IAAS_v1.1_function_annotation.zip：压缩格式，含高置信度与低置信度基因的功能注释
• 转座子注释文件：
• TE_v1.1.gff3：GFF3格式，转座子注释数据
• TE_v1.1.class.gff3：GFF3格式，含转座子分类信息的注释数据
• 代码/软件：
• 分析流程涉及的软件包见方法部分，组装与评估代码可通过GitHub获取（https://github.com/liushoucheng/SPART）

数据来源

北京大学现代农业研究院

适用场景

• 小麦基因组演化研究：分析六倍体小麦基因组结构特征与演化规律
• 功能基因组学研究：解析小麦基因结构、功能及表达调控机制
• 转座子生物学研究：探究转座子在小麦基因组中的分布与分类
• 作物遗传改良：为小麦分子育种提供高精度基因组参考数据支持