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ZooKeys_补充材料_波多黎各Stauropathes新物种研究补充材料数据
数据集概述 本数据集是论文《Description of a new species of Stauropathes (Anthozoa, Antipatharia, Schizopathidae) from Puerto...
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Picea_abies_Based_挪威云杉耐旱性基因多态性与生理性状关联研究数据
数据集概述 本数据集包含斯洛伐克中部5个海拔梯度(550至1280米)挪威云杉种源在干旱胁迫和对照(充分浇水)条件下的研究数据,涵盖生理性状、ddRAD测序数据及nSSR基因型三类内容,共6个文件,用于分析基因多态性与生理性状的关联。 文件详解 生理性状数据文件...
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Attwater_Prairie_chicken_Based濒危鸟类近交衰退研究数据
数据集概述 本数据集为濒危物种Attwater草原鸡近交衰退研究的配套数据,包含系谱与DNA两种方法的对比分析数据,涉及雏鸡生存、成体生存、基因型及线粒体DNA序列等信息,用于评估近交对该物种的影响,辅助保护管理决策。 文件详解 APC_chick_survival_Final.sav 文件格式:.sav...
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Metazoa_Phylogenetic_Signal_后生动物系统发育基因组数据集
数据集概述 本数据集为后生动物系统发育研究的基因组数据,包含1080个直系同源基因座,源自36个公开基因组,覆盖主要动物类群。数据用于优化系统发育信号分区,支持栉水母作为其余后生动物姊妹群的结论,提供基因组系统发育分析的工作流与工具,共15个文件。 文件详解 RAxML_single_genes.zip 文件格式:ZIP...
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Culicoides_imicola_Based_地中海定殖遗传数据_研究数据集
数据集概述 本数据集为媒介昆虫Culicoides imicola地中海定殖研究的遗传数据,包含微卫星数据、多个基因(Efa、Cytb、COI)的序列比对文件及样本ID信息,共5个文件,用于分析该物种的种群遗传结构、定殖历史及与蓝舌病疫情的关联。 文件详解 Jacquet_C.imicola_microsatellite_data.txt...
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Hybrid_Sequencing_Based_小麦热胁迫感知与信号传导转录组数据
数据集概述 本数据集为小麦(Triticum aestivum L.)在热胁迫(HS)下的时空转录组图谱数据,通过混合测序技术(单分子全长测序+Illumina短读长测序)生成,包含旗叶和灌浆籽粒在0分钟、5分钟、10分钟、30分钟、1小时、4小时热胁迫下的转录组信息,新发现4,947个基因座和70,285个转录本,补充了小麦参考基因组注释。 文件详解...
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JOH2015154R1_Based_马MC1R和ASIP基因座与行为关联研究原始数据
数据集概述 本数据集围绕马的MC1R和ASIP基因座与行为性状的关联展开研究,包含215匹北美田纳西走马的基因分型数据及行为评分数据。通过PCR和RFLP方法获取基因数据,采用 handler 评分结合主成分分析得到4个行为表型因子,旨在探究毛色基因与行为的相关性,为神经内分泌机制研究提供动物模型。 文件详解...
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Pollinator_Isolation_Based_兰科植物传粉者介导生殖隔离研究数据
数据集概述 本数据集围绕两种形态相似、亲缘关系密切的同域兰科植物(Chiloglottis valida和C. aff....
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Gila_Colorado_River_Basin_北美西部沙漠鱼类杂交基因侵蚀研究数据
数据集概述 本数据集围绕北美西部科罗拉多河流域两种特有同域鱼类(Gila cypha和G. robusta)的杂交基因侵蚀展开研究,包含368个个体的ddRAD测序相关数据,用于分析人为栖息地改变对物种繁殖隔离、基因渐渗及生物多样性的影响。 文件详解 样本元数据文件 文件名称:gila_ub_sra_metadata.xlsx 文件格式:XLSX...
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Faster_X_Effects_Based_果蝇X染色体与常染色体进化速率比较研究数据
数据集概述 本数据集为研究果蝇X染色体快速进化效应的相关数据,包含黑腹果蝇和拟暗果蝇两个类群的全基因组编码序列进化率分析结果,涉及X染色体与常染色体基因座的适应性替换差异,以及拟暗果蝇类群中祖先X染色体与常染色体融合事件对基因进化的影响,共含一个文件。 文件详解 文件名称:Alignments.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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Greater_Flamingo_MHC_Class_IIB_Diversity研究数据
数据集概述 本数据集记录了地中海地区四个繁殖群中116只大火烈鸟的MHC IIB基因分型数据,包含2个基因座的109个等位基因信息。数据用于研究该种群MHC基因多样性及空间分化情况,发现其具有极高的基因多样性且无种群结构差异,为分析病原体介导的选择机制提供支持。 文件详解...
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Astyanax_mexicanus_Based_墨西哥丽脂鲤洞穴与表层种群基因型研究数据
数据集概述 本数据集聚焦墨西哥丽脂鲤(Astyanax mexicanus)洞穴、表层及杂交种群的基因型信息,包含2个文件。核心数据为ABI3730测序仪输出的片段大小或基因型数据,对应Borowsky 2022研究中表2的原始数据,涉及M1、M2、M3等基因座,用于探究种群分化维持机制及选择对表型的影响。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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INNUENDO_Based_小肠结肠炎耶尔森氏菌wgMLST与cgMLST数据_2018
数据集概述 本数据集包含小肠结肠炎耶尔森氏菌的全基因组多位点序列分型(wgMLST)和核心基因组多位点序列分型(cgMLST)方案及相关数据。数据基于2018年8月检索的252个公开基因组和79个INNUENDO项目新菌株,经INNUca组装、chewBBACA处理后形成,含元数据、基因组组装结果、MLST方案文件及等位基因谱。 文件详解 元数据文件...
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Integrative_Based_Heuchera_longiflora物种分化研究数据
数据集概述 本数据集为Heuchera longiflora物种分化研究的整合分析数据,包含56个种群的7个分子标记及12个代表性种群的277个核标记数据,通过Sanger测序和NGS技术结合形态学数据,识别该物种的初始谱系,为种下分类单元界定提供证据支持。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,6个文件)...
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Enterobase_Source_沙门氏菌cgMLST方案chewBBACA适配数据2018
数据集概述 本数据集为沙门氏菌(Salmonella enterica)的cgMLST方案,2018年6月11日通过Enterobase网络API下载。方案包含Enterobase原3002个基因座中的3000个可用于chewBBACA工具的编码序列基因座,用于微生物基因组分型分析,数据集以压缩包形式提供。 文件详解...
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Providencia_rettgeri_Based_果蝇细菌感染抗性与耐受性遗传架构研究数据
数据集概述 本数据集为果蝇(Drosophila melanogaster)对雷氏普罗威登斯菌(Providencia rettgeri)感染的抗性与耐受性遗传架构研究数据,包含基因组关联分析结果、感染后适合度与感染强度的回归残差数据,以及30个耐受相关基因座信息,用于探究宿主防御策略的遗传基础及抗性与耐受性的关联。 文件详解 TXT文件(共7个)...
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Pygospio_elegans_DNA_Methylation_发育模式表观遗传调控研究数据
数据集概述 本数据集围绕多毛类蠕虫Pygospio elegans的DNA甲基化展开研究,对比了不同发育模式后代的怀卵雌性、非繁殖雌性的甲基化谱,验证该物种存在基因内CpG位点甲基化及相关甲基化基因,探讨表观遗传调控对发育模式转变的潜在作用。 文件详解 文件名称:README_for_MS-AFLP_data.txt 文件格式:TXT...
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Drosophila_mojavensis_Based_种内分化模型比较与种群历史关系研究数据
数据集概述 本数据集围绕嗜仙人掌果蝇Drosophila mojavensis的种内遗传分化展开,包含基于隔离迁移模型分析的序列数据,涉及下加利福尼亚、索诺拉-亚利桑那大陆及莫哈韦沙漠种群的15个X连锁内含子基因座,还对比了8个常染色体基因座的既有数据,用于解析种群历史关系及分化时间。 文件详解 IMa2 input files.zip...
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Posidonia_oceanica_Based_地中海特有海草深度与纬度梯度适应性响应研究数据
数据集概述 本数据集聚焦地中海特有海草Posidonia oceanica,通过离群值分析和全基因组转录组分析,筛选受环境选择的基因,探究其沿深度和纬度梯度的适应性响应,涉及种群基因流、局部适应及长期存续风险等核心内容。 文件详解 README_for_matrix_MLGs_for_all_loci_dryad.txt.docx 文件格式:DOCX...
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Drosophila_melanogaster_Source_黑腹果蝇翅膀形态性冲突进化研究数据
数据集概述 本数据集围绕黑腹果蝇翅膀大小与形状的性冲突展开,记录了通过限制染色体向雄性传递消除基因座内性冲突的实验结果,包含雌雄两性翅膀形态、体型、生长速率等表型变化及发育稳定性数据,为研究性二态性进化约束提供支撑。 文件详解 文件名称:Abbottetal.JEBdryaddata.xlsx 文件格式:XLSX...



