数据集概述
本数据集包含斯洛伐克中部5个海拔梯度(550至1280米)挪威云杉种源在干旱胁迫和对照(充分浇水)条件下的研究数据,涵盖生理性状、ddRAD测序数据及nSSR基因型三类内容,共6个文件,用于分析基因多态性与生理性状的关联。
文件详解
- 生理性状数据文件
- 文件名称:hrivnak.phenotyp.data.csv、hrivnak.phenotyp.data.xlsx
- 文件格式:CSV、XLSX
- 字段映射介绍:记录干旱胁迫和对照条件下挪威云杉幼苗的生理性状指标(具体指标未明确说明)
- ddRAD测序数据文件
- 文件名称:hrivnak.ddRAD.data.csv、hrivnak.ddRAD.data.xlsx
- 文件格式:CSV、XLSX
- 字段映射介绍:包含Variant(变异位点)、Individual(个体编号)、control(对照样本)、drought(干旱样本)等字段,记录不同水分条件下的双酶切RAD测序数据
- nSSR基因型数据文件
- 文件名称:hrivnak.nSSR.data.csv、hrivnak.nSSR.data.xlsx
- 文件格式:CSV、XLSX
- 字段映射介绍:包含Variant(变异类型)、Individual(个体编号)、Population(种群)、Locus(基因座,如pgGB3、pgGB5等)等字段,记录核微卫星基因型数据
适用场景
- 植物遗传学研究: 分析挪威云杉核苷酸多态性与生理性状的关联
- 耐旱性机制研究: 比较干旱胁迫与对照条件下的基因表达和生理响应差异
- 种源适应性分析: 探究不同海拔梯度种源的遗传多样性与环境适应性
- 分子标记开发: 利用ddRAD和nSSR数据开发挪威云杉分子标记
- 气候变化响应研究: 评估挪威云杉对水分胁迫的遗传和生理响应机制