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Dryad_Based_东南亚兜兰属网状进化与海平面波动研究数据
数据集概述 本数据集为东南亚兜兰属(Paphiopedilum)物种多样化研究的支撑数据,包含基于8个叶绿体DNA区域和4个低拷贝核基因的序列比对、系统发育树文件、BEAST分析文件及SplitsTree网络分析文件,用于探究网状进化与海平面波动对该属物种分化的驱动作用,共4个压缩文件。 文件详解 文件名称:Alignment of the...
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Mytilus_Based_加州中部入侵与本地贻贝基因渐渗研究数据
数据集概述 本数据集围绕加州中部贻贝杂交区展开,通过ddRADseq技术对1337个单核苷酸多态性位点进行基因分型,分析入侵种Mytilus galloprovincialis与本地种Mytilus trossulus的基因渐渗方向、程度及隔离屏障作用。数据集包含9个文件,支持区分早期与晚期杂交世代,揭示杂交区基因交流的空间异质性及动态变化。 文件详解...
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Podarcis_muralis_普通墙蜥颜色装饰气候影响研究数据
数据集概述 本数据集为普通墙蜥(Podarcis muralis)颜色装饰气候影响研究的补充数据,包含114个种群的颜色装饰地理分布、基因流及气候关联分析数据,验证气候对性选择表型进化及基因渐渗的作用,共3个文件。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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mtDNA_Based_roe_deer线粒体渐渗进化中性研究数据
数据集概述 本数据集围绕roe deer(狍属)线粒体DNA(mtDNA)渐渗的进化中性展开研究,包含16个欧洲狍(Capreolus capreolus)和西伯利亚狍(C....
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Dryad_Source_欧洲普通鹌鹑入侵等位基因渐渗检测与模拟数据
数据集概述 本数据集为欧洲普通鹌鹑种群基因渐渗研究的基因型数据,源于对某普通鹌鹑种群15年的遗传监测,结合模拟分析探究入侵等位基因(来自杂交种鹌鹑)的渐渗情况。数据包含基因型信息,用于验证渐渗是否发生及评估检测能力,揭示渐渗率低可能与杂合个体适合度降低有关。 文件详解 文件名称:Genotypes Dryad_Sanchez-Donoso et...
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Hercules_Based_大力神甲虫种间基因渐渗与表型同化研究数据
数据集概述 本数据集围绕大力神甲虫(Dynastes属)种间基因渐渗与表型同化展开研究,包含RADseq基因数据与博物馆标本图像数据,用于重建物种树、分析渐渗历史及探究体色等适应性性状的表型相似性。数据验证了地理邻近(邻域分布)物种间的基因渐渗现象,探讨了系统发育关系、表型相似性与渐渗的关联,共含7个文件。 文件详解 样本信息文件...
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Rhizophora_Based红树植物遗传分化与系统地理学研究数据
数据集概述 本数据集基于20个核SSR标记,研究部分同域分布的红树植物Rhizophora mucronata和R. stylosa的遗传分化与系统地理学特征,包含物种遗传独特性、种群遗传结构及洋流对基因流的影响等核心内容,为红树林保护提供遗传学依据。 文件详解 文件名称:Genalex_RM_RS.xlsx 文件格式:XLSX...
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Mesocarabus_Integration_物种界定整合分类数据
数据集概述 本数据集围绕Mesocarabus甲虫的物种界定展开,整合了分子系统发育、形态测量和生态位分化等多源数据,通过分析不同性状间的冲突,提出了包含杂交谱系的物种界定策略。数据集涵盖DNA序列比对、形态测量及系统发育分析文件,为研究该类群的进化历史与物种边界提供支持。 文件详解 文档类文件...
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Dryad_Based_草地蝗虫杂交带物种形成后期基因渐渗研究数据集
数据集概述 本数据集围绕草地蝗虫Pseudochorthippus parallelus的自然杂交带展开,聚焦物种形成后期的基因渐渗现象,结合线粒体与核基因数据,分析生殖隔离屏障(如杂交雄性不育)的演化速度及其对遗传边界维持的影响,包含27个相关数据文件。 文件详解 文档类文件...
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Micropterus_Based黑鲈属系统基因组学与物种界定研究数据
数据集概述 本数据集围绕经济重要性淡水鱼类黑鲈属(Micropterus)展开,通过ddRAD数据的系统基因组学分析,界定出19个物种,修正了大口黑鲈复合体的分类命名,并提供了物种系统发育关系及基因渐渗对分化历史的影响等研究结果,为黑鲈属的管理与保护提供科学依据。 文件详解 文档类文件...
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Larus_marinus_Based北美大黑背鸥线粒体基因渐渗研究数据
数据集概述 本数据集支持北美大黑背鸥(Larus marinus)与美洲银鸥(Larus smithsonianus)的基因渐渗研究,聚焦线粒体DNA(mtDNA)与核DNA的渐渗差异。数据源于对两种鸥类的遗传学分析,揭示北美大黑背鸥中来自美洲银鸥的单向mtDNA广泛渐渗现象,而核DNA渐渗极少,为探讨物种入侵过程中的基因交流机制提供基础数据。...
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DFOIL_Based五分类群系统发育基因渐渗检测工具与示例数据2015
数据集概述 本数据集包含用于五分类群对称系统发育中基因渐渗检测的DFOIL方法相关文件,包括检测工具代码、模拟脚本、说明文档及示例数据,支持基因渐渗事件的供体与受体谱系识别,适用于系统发育基因组数据分析。 文件详解 文档文件 文件名称:README_for_dfoil.md 文件格式:MD...
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Soldanella_Based_欧洲高山植物基因渐渗与物种分化研究数据
数据集概述 本数据集聚焦欧洲高山植物Soldanella属(报春花科)的基因渐渗研究,整合了质体基因组、核基因组(RAD-seq)及细胞遗传学数据,分析杂交与渐渗在该属快速分化中的作用。数据覆盖属内物种演化历史中的基因流动模式,尤其关注喀尔巴阡物种的核型变异与渐渗程度,揭示杂交对物种形成和遗传多样性的影响。 文件详解 README文件...
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Anguilla_marmorata_花鳗鲡种群内结构与基因渐渗研究数据
数据集概述 本数据集基于花鳗鲡(Anguilla marmorata)的858个AFLP标记和1117个个体的基因分型数据,研究其种群间遗传分化程度、基因渐渗率及种群内遗传模式。数据识别出三个分化种群,揭示了杂交个体与亲本基因型在接触区共存的现象,以及不同位点基因渐渗率的差异,为理解海洋鱼类种群内结构形成机制提供支持。 文件详解...
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Salmo_salar_Based_大西洋鲑鱼补充放流基因型选择研究数据
数据集概述 本数据集围绕大西洋鲑鱼补充放流的遗传影响展开,验证孵化场放流对野生种群基因渐渗的选择作用,发现渐渗亲鱼后代数量是非渐渗亲鱼的四倍,导致放流种群驯化基因型增加,为放流对野生种群适应性的影响提供实证依据。 文件详解 代码文件 文件名称:seaAge_analysis.cpp 文件格式:.cpp...
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Dryad_Source_向日葵作物野生杂交种竞争条件下适应性研究数据集
数据集概述 本数据集记录美国堪萨斯州田间实验中,野生向日葵、F1、F2及回交野生(BCw)四种杂交类型在不同种间和种内竞争条件下的适应性表现,涵盖出苗、存活至繁殖及种子产量等全生命周期指标,用于分析竞争对作物与野生向日葵基因渐渗的影响。 文件详解 文件名称:Mercer et al PLOS ONE Environmental treatments...
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Acropora_Based_珊瑚物种复合体遗传多样性与基因渐渗研究数据
数据集概述 本数据集为Acropora属中A. cytherea和A. hyacinthus两个珊瑚物种复合体的遗传研究数据,包含12个基因组区域的DNA序列分析结果,覆盖印度洋-太平洋5-7个分布地点,识别出至少6个隐存物种,并分析了物种间基因渐渗历史,共8个文件。 文件详解 存档文件(Archive files)...
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Dryad_Seed_Fates_向日葵作物_野生杂交种种子命运实验数据
数据集概述 本数据集记录了向日葵(Helianthus annuus)作物、野生及杂交种的种子命运实验结果,通过田间埋藏实验分析母本类型和核遗传组成对种子萌发、休眠与死亡率的影响,重点探究作物等位基因及母本效应对杂交种种子命运的作用,为作物-野生杂交区的基因渐渗研究提供数据支持。 文件详解...
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Oryza_rufipogon_Based_亚洲野生稻群体遗传学研究数据
数据集概述 本数据集来源于亚洲野生稻(Oryza rufipogon)群体遗传学研究,包含108份亚洲野生稻样本的42个全基因组序列标签位点(STS)的序列变异数据。研究通过贝叶斯聚类、主成分分析和AMOVA等方法,揭示了两个遗传分化群体(Ruf-I和Ruf-II)的地理渐变模式,支持亚洲栽培稻(O....
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Dryad_Source_法国阿尔卑斯山刺柏属物种杂交AFLP分子标记数据
数据集概述 本数据集记录法国阿尔卑斯山Saint Crépin地区刺柏属物种杂交研究的AFLP分子标记数据。该区域存在四倍体Juniperus thurifera与二倍体J. sabina同域分布,发现3株形态异常个体。通过AFLP标记分析147个多态性位点,证实杂交起源并发现回交可能性,为不同倍性刺柏自然杂交提供证据。 文件详解 Read_Me-...



