找到48个数据集

标签: fas

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  • 安第斯山Petroravenia属_十字花科_Thelypodieae族_基于形态学和分子数据的重新评估数据集

    2025年12月10日   

    数据集概述 本数据集围绕安第斯山十字花科Petroravenia属的分类学重新评估展开,包含基于核基因(ITS)和质体基因(trnL-F、trnH-psbA)的分子系统发育分析数据、形态学比较结果及分类修订信息,为研究该属的系统发育关系、分类地位及濒危物种保护提供支持。 文件详解 分子系统发育数据文件...
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  • 新热带蜘蛛属Ciniflella补充数据集

    2025年12月8日   

    数据集概述 本数据集是关于新热带蜘蛛属Ciniflella(Araneae: Zoropsidae, Tengellinae)研究的补充数据,包含系统发育数据集、系统发育树及补充图表,为该属蜘蛛的分类学与系统发育研究提供数据支持。 文件详解 序列文件(.fas格式,共7个): 12s.fas:12S DNA标记的序列比对文件 16s.fas:16S...
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  • 韩国沿海地区新物种Adota_Casey_1910_鞘翅目_隐翅虫科_Aleocharinae亚科_形态与分子分析数据集

    2025年12月7日   

    数据集概述 该数据集包含韩国沿海地区发现的新物种Adota Casey,1910(鞘翅目:隐翅虫科:Aleocharinae亚科)的形态与分子分析相关数据,为该新物种的分类学研究提供支持。 文件详解 分子序列文件: Adota_elongata_COI.fas: 格式为.fas,可能包含该新物种的COI基因序列数据...
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  • 马达加斯加丝绒壁虎属分子多样性调查与新物种描述数据集

    2025年12月6日   

    数据集概述 本数据集为相关研究论文的配套数据,包含马达加斯加丝绒壁虎属(Blaesodactylus)的分子多样性调查数据,涉及DNA序列、系统发育树、物种界定分析结果、标本照片及形态测量数据,支撑新物种描述研究。 文件详解 分子序列与比对文件:...
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  • 曲霉属曲霉组多相分类与室内及食品环境分布数据集

    2025年12月6日   

    数据集概述 该数据集围绕曲霉属曲霉组(原散囊菌属)的多相分类研究展开,涵盖形态特征、次生代谢产物、生理特性及系统发育分析数据,涉及全球室内环境与食品基质中的菌株鉴定及分类结果。 文件详解 系统发育分析文件(.fas、.fasta格式): benA.fas、caM.fas、ITS.fas、RPB2.fasta:分别包含β-...
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  • 法劳按蚊复合体嗅觉基因比对与全基因组SNP数据集

    2025年11月30日   

    数据集概述 本数据集包含法劳按蚊复合体中四类主要昆虫化学感应基因家族的编码序列核苷酸比对数据,以及全基因组SNP数据,关联于研究宿主偏好差异与嗅觉基因关系的手稿,还提供计算kA/kS的R代码。 文件详解 该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下: - 核心数据文件: -...
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  • 猩猩线粒体与Y染色体DNA序列数据集

    2025年11月29日   

    数据集概述 该数据集包含与新猩猩物种研究相关的线粒体和Y染色体DNA序列数据,支持从基因组层面验证物种分类,核心数据对应《Current Biology》2017年发表的相关研究成果。 文件详解 文件名称:Pongo_mtDNA_HVR1excl.fas 文件格式:.fas 内容说明:猩猩线粒体DNA HVR1区域(排除部分片段)的序列文件...
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  • dsrAB参考树与环境序列分类归属数据集

    2025年11月29日   

    数据集概述 本数据集包含用于环境序列分类归属的dsrAB蛋白参考数据库、系统发育树及相关分析文件,基于Müller等(2015)的数据集更新,涵盖经人工校对的1313条dsrAB蛋白序列分类信息,支持环境序列的系统发育分析与分类归属研究。 文件详解 文件名称: mothur.batch:格式为.batch,是Mothur...
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  • 绿藻目叶绿体基因数据集

    2025年11月29日   

    数据集概述 该数据集包含绿藻目(Cladophorales)多种绿藻的叶绿体基因序列数据,涉及Chaetomorpha aerea、Cladophora albida等9个物种,以.fas和.fasta格式存储,主要用于研究其叶绿体基因组特征。 文件详解 基因序列文件:...
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  • 藻红蛋白特异性小鼠抗体数据集

    2025年11月29日   

    数据集概述 该数据集包含针对藻红蛋白(phycoerytherin)的小鼠抗原特异性免疫球蛋白重链序列,涉及Balb/c、C.B-17和B6三种小鼠品系,覆盖免疫前( naive)和免疫后(memory)不同阶段,为相关抗体研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含两个目录下的二十六份FASTA格式文件,具体说明如下: - 目录结构: -...
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  • 地衣原墙衣属年龄依赖性共生藻多样性数据集

    2025年11月28日   

    数据集概述 该数据集包含地衣原墙衣属(Protoparmeliopsis muralis)真菌与藻类共生体的核ITS rDNA序列多组比对数据,涵盖桑格测序的真菌序列、专属特雷布ouxia属的藻类序列以及其他藻类类群序列,为研究其年龄依赖性共生藻多样性提供支持。 文件详解 真菌序列文件: 文件名称: fungi.fas 文件格式: FAS (.fas)...
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  • 古菌与细菌arsM基因分类数据库

    2025年11月28日   

    数据集概述 该数据集包含古菌arsM基因和细菌arsM基因的分类数据库,分别收录143条和105条序列,对应141个古菌种和105个细菌种。所有序列无模糊碱基,均聚物长度控制在4-8个碱基,为基因分类研究提供标准化数据支持。 文件详解 数据集包含两个FAS格式文件,具体说明如下: - 文件名称: Database for bacterial arsM...
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  • 墨西哥朱雀血孢子虫细胞色素b共识序列数据集

    2025年11月28日   

    数据集概述 本数据集包含墨西哥朱雀(Haemorhous mexicanus)体内血孢子虫寄生虫的细胞色素b(cyt B)共识序列数据,为研究野生朱雀病原体诱导应激及白细胞动态作为健康指标提供分子生物学层面的支持。 文件详解 文件名称: Mexican_HOFI_Haemosporida.fas 文件格式: 核酸序列格式(.fas) 文件内容:...
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  • 绿藻目叶绿体基因比对数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 该数据集包含绿藻目叶绿体基因的核苷酸与氨基酸序列比对数据,支持相关研究对叶绿体基因组结构的分析,共含40个文件,以序列比对格式为主。 文件详解 文件类型与分布: .fasta格式文件(21个,占52.5%):如aa_01_atpA.fasta、aa_02_atpB.fasta等,存储氨基酸序列比对数据...
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  • 锥虫物种15个直系同源基因多序列比对数据集

    2025年11月28日   

    数据集概述 该数据集包含15个锥虫物种直系同源基因的多序列比对数据,覆盖GPX、HSP70、PDH等基因类型,所有文件均为.fas格式,为研究锥虫的系统发育关系(如兰氏锥虫与旧世界锥虫的亲缘性)提供基础序列数据支持。 文件详解 多序列比对文件(共15个,均为.fas格式): 具体文件示例:gene11 GPX.fas、gene3...
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  • 植物抗病小体的起源与进化补充材料数据集

    2025年11月28日   

    数据集概述 本数据集是论文《植物抗病小体的起源与进化》的补充材料,包含支持论文中图2、图4及图S6的系统发育分析数据,具体涉及ZAR1、ZRK及PBL2相关蛋白的进化关系研究,为植物免疫机制的进化分析提供数据支持。 文件详解 该数据集按图表对应数据分类存储,具体说明如下: - 3n3stnvzyk-1/Data for Fig2/ 目录: -...
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  • 地下水端足类Niphargus属两种物种地表扩散研究数据集

    2025年11月28日   

    数据集概述 本数据集围绕地下水端足类Niphargus属的hrabei和valachicus两种物种展开,包含其基因序列比对、系统发育树及扩散历史可视化文件,用于研究地下生活方式的可逆性及近期向地表水的大规模扩散现象。 文件详解 该数据集包含多种类型的研究文件,具体说明如下: - 基因序列比对文件(.fas格式): -...
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  • 北海黑尔戈兰岛蜱虫及相关微生物分析数据集2024

    2025年11月28日   

    数据集概述 本数据集包含2024年在北海黑尔戈兰岛采集的蜱虫及其携带的博氏疏螺旋体、立克次体等相关微生物的测序信息,同时记录了蜱虫的采样位置、时间及鉴定编号等基础信息,为蜱传微生物研究提供数据支持。 文件详解 该数据集由多个文件和目录组成,具体说明如下: - 蜱虫基础信息文件: -...
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  • 地中海托湖冬季水华新微藻物种Picochlorum_tauri系统基因组学数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 本数据集围绕地中海托湖冬季水华新微藻物种Picochlorum tauri展开,包含其基因组序列、注释数据及与其他绿藻门物种的比较基因组学分析结果,为研究该物种代谢潜力提供系统基因组学数据支持。 文件详解 目录:Phylogenomics untangles the metabolic potential of/ 文件列表:...
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  • 斯里兰卡陆生蜗牛Corilla的CO1_ND1_16S_rRNA串联DNA序列比对数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 本数据集包含斯里兰卡陆生蜗牛Corilla(柄眼目:Corillidae科)的三个线粒体基因(CO1、ND1、16S rRNA)的四组串联序列比对数据,含插入缺失(indels),用于基于线粒体DNA的分类学研究,所有序列使用MAFFT v.7软件进行比对。 文件详解 该数据集包含四个FAS格式的序列比对文件,具体说明如下: -...
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